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Enregistrement W4295088693 · doi:10.1093/brain/awac330

<i>ATP6V0C</i> variants impair V-ATPase function causing a neurodevelopmental disorder often associated with epilepsy

2022· article· en· W4295088693 sur OpenAlexaff
Kari A. Mattison, Gilles Tossing, Fred Mulroe, Callum Simmons, Kameryn M. Butler, Alison Schreiber, Adnan Alsadah, Derek Neilson, K Naess, Anna Wedell, Anna Wredenberg, Arthur Sorlin, Emma McCann, George J. Burghel, Beatriz Menéndez, George Hoganson, Lorenzo D. Botto, Francis Filloux, Ángel Aledo‐Serrano, António Gil‐Nagel, Katrina Tatton‐Brown, Nienke E. Verbeek, Bert van der Zwaag, Kyrieckos A. Aleck, Andrew C. Fazenbaker, Jorune Balciuniene, Holly Dubbs, Eric D. Marsh, Kathryn B. Garber, Jakob Ek, Morten Dunø, Christina Engel Hoei‐Hansen, Matthew A. Deardorff, Gordana Raca, Catherine Quindipan, Michèle Van Hirtum-Das, Jeroen Breckpot, Trine Bjørg Hammer, Rikke S. Møller, Andrea Whitney, Andrew G. L. Douglas, Mira Kharbanda, Nicola Brunetti‐Pierri, Manuela Morleo, Vincenzo Nigro, Halie May, James X. Tao, Emanuela Argilli, Elliot H. Sherr, William B. Dobyns, Richard A. Baines, Jim Warwicker, Jennifer Parker, Siddharth Banka, Andrew Escayg

Notice bibliographique

RevueBrain · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueATP Synthase and ATPases Research
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteMedical Research CouncilNational Heart, Lung, and Blood InstituteWinship Cancer InstituteCitizens United for Research in EpilepsyFonds Wetenschappelijk OnderzoekDepartment of Health and Social CareNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Institute for Health and Care ResearchNational Institutes of HealthCancer Research UKVlaamse regeringEuropean CommissionBroad InstituteNational Human Genome Research InstituteWellcome TrustNational Cancer InstituteEmory University
Mots-clésEpilepsyNeuroscienceNeurodevelopmental disorderMedicinePsychologyPsychiatryAutism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The vacuolar H+-ATPase is an enzymatic complex that functions in an ATP-dependent manner to pump protons across membranes and acidify organelles, thereby creating the proton/pH gradient required for membrane trafficking by several different types of transporters. We describe heterozygous point variants in ATP6V0C, encoding the c-subunit in the membrane bound integral domain of the vacuolar H+-ATPase, in 27 patients with neurodevelopmental abnormalities with or without epilepsy. Corpus callosum hypoplasia and cardiac abnormalities were also present in some patients. In silico modelling suggested that the patient variants interfere with the interactions between the ATP6V0C and ATP6V0A subunits during ATP hydrolysis. Consistent with decreased vacuolar H+-ATPase activity, functional analyses conducted in Saccharomyces cerevisiae revealed reduced LysoSensor fluorescence and reduced growth in media containing varying concentrations of CaCl2. Knockdown of ATP6V0C in Drosophila resulted in increased duration of seizure-like behaviour, and the expression of selected patient variants in Caenorhabditis elegans led to reduced growth, motor dysfunction and reduced lifespan. In summary, this study establishes ATP6V0C as an important disease gene, describes the clinical features of the associated neurodevelopmental disorder and provides insight into disease mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,830
Score d'incertitude au seuil0,596

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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