Effects of a Carnobacterium maltaromaticum strain at natural contamination levels on the microbiota of vacuum-packaged beef steaks during chilled storage
Notice bibliographique
Résumé
We investigated the impact of a Carnobacterium maltaromaticum strain at a natural contamination level on the dynamics of microbiota and survival of Escherichia coli O157:H7 and Salmonella enterica serovar Typhimurium on chilled vacuum-packaged (VP) beef. C. maltaromaticum A5 up to 2 log CFU/cm 2 was spiked onto beef steaks with or without E. coli O157:H7 and S . Typhimurium. The steaks were vacuum-packaged and stored at 2 °C for 12 weeks. The dynamics of the microbiota were determined using plating and 16S rRNA gene amplicon sequencing methods. The predominant bacterial species in the final microbiota were determined using whole metagenome and genome sequencing. C. maltaromaticum on inoculated meat peaked at week 2 (>80%) even though the initial relative abundance was as low as <1%. The relative abundance of indigenous Latilactobacillus was 0.1–0.5%, but gradually increased to 75.7–100% at week 12, displacing Carnobacterium . The predominant species in the final microbiota was identified as Latilactobacillus sakei subsp. carnosus, which harbored gene clusters encoding Sakacin G and a putative class IIc bacteriocin. Neither of the two pathogens was affected by C. maltaromaticum A5. Taken together, this study indicates that the initial microbial composition plays an important role in the fate of an introduced LAB strain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».