Notice bibliographique
Résumé
Abstract Synovial sarcoma (SS) is an aggressive soft-tissue malignancy that can arise in any area of the body, and most frequently affects adolescents and young adults. The 10-year survival rate has been estimated at 50%. SS is characterized by a pathognomonic t(X;18)(p11.2;q11.2) translocation which produces a fusion oncogene named SS18-SSX. In mouse models, expression of SS18-SSX is sufficient to drive the development of SS-like tumors. Despite recent advancements in our understanding of SS biology, the cell of origin remains undefined. In most instances, it is likely mesenchymal in nature. We previously generated a mesenchymal progenitor (MP) specific Cre line that has enabled us to identify MPs within the embryo [MOU1], and characterize and define their lineage trajectories through development into the adult. This line has been used to generate a unique mouse model of SS where the human SS18-SSX fusion oncogene with an EGFP marker is conditionally expressed in adult MPs. This model shows 100% penetrant SS tumor formation with a median latency period of 16 weeks. Histologic analyses of tumors reveal characteristic cellular morphology and the expression of common markers of SS. Single-cell (sc) RNA-seq gene expression profiles of murine tumors recapitulate those observed in human SS samples and highlight genetic programs involved in sarcomagenesis. Using this model, we can identify and isolate neoplastic lesions prior to the development of grossly visible tumors and trace these cells through the complete transformation continuum. By comparing tumor cells to normal MPs, we aim to better understand the mechanisms underlying the SS18-SSX induced transformation of MPs. Together, this model identifies a cell of origin for SS and provides us with a unique opportunity to address the molecular and cellular drivers of SS. Citation Format: T. Michael Underhill. Mesenchymal progenitors and sarcomagenesis [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: Sarcomas; 2022 May 9-12; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2022;28(18_Suppl):Abstract nr IA004.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».