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Enregistrement W4295926608 · doi:10.1158/1557-3265.sarcomas22-pr009

Abstract PR009: A new invasive zebrafish model of ewing sarcoma reveals EWSR1-FLI1-driven dysregulation of heparan sulfate proteoglycan metabolism and ERK signaling in developing tumors

2022· article· en· W4295926608 sur OpenAlexaboutno aff
Elena Vasileva, Mikako Warren, Timothy J. Triche, James F. Amatrud

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZebrafishBiologyTumor microenvironmentSarcomaCancer researchFLI1AngiogenesisMetastasisOncogeneCancerExtracellular matrixTumor progressionPathologyCell biologyMedicineGeneticsCell cycleGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ewing sarcoma is a malignant tumor of bones or soft tissues with an extremely poor prognosis for patients with metastatic or relapsed disease. Ewing sarcoma is associated with the appearance of a chimeric fusion oncogene, most frequently EWSR1-FLI1 (EF1). The interaction of Ewing sarcoma cells with the tumor microenvironment is essential for tumor growth, angiogenesis, and metastasis. The tumor microenvironment includes surrounding blood vessels, immune cells, signaling molecules, and extracellular matrix. The dependence of a tumor cell on its microenvironment opens new possibilities to target not just cancer cells but also the tumor microenvironment itself. In the absence of a representative in vivo model, the role of tumor cell/microenvironmental interactions in Ewing sarcoma initiation and progression is not well-understood. To address these concerns, we developed a new in vivo genetic model of Ewing sarcoma by integrating the human EWSR1-FLI1 fusion oncogene into the zebrafish genome. Our system allows broad mosaic Cre-inducible expression of human EF1 in zebrafish, which causes rapid onset of Ewing sarcoma at high penetrance. This invasive model allows studying the behavior of GFP-labeled cancer cells during tumor initiation and progression, in a complex developmental context which is not currently possible in mammals. We found that observed tumors express canonical EF1 target genes and stain for known Ewing sarcoma markers including CD99. Proteomic analysis revealed that EF1 expression affects the expression of enzymes involved in heparan sulfate proteoglycan (HSPG) metabolism. Such dysregulation of proteoglycan metabolism is associated with activation of ERK1/2 signaling pathway in tumor cells resulting in increased tumor cell proliferation and survival. Proteoglycans are key regulators of signaling of cell surface receptors, playing an essential role in cell-to-cell communication. Targeting heparan sulfate proteoglycans with the specific heparan sulfate antagonist Surfen reduces ERK1/2 signaling and decreases tumorigenicity of Ewing sarcoma cells in vitro and in vivo. Taken together, our new zebrafish model will open new possibilities to study EWSR1-FLI- driven tumorigenesis, as well as mechanisms of tumor development and progression. Our results highlight the important role of the extracellular matrix in Ewing sarcoma tumor growth and the potential of agents targeting proteoglycan metabolism as novel therapies for this disease. Citation Format: Elena Vasileva, Mikako Warren, Timothy J. Triche, James F. Amatrud. A new invasive zebrafish model of ewing sarcoma reveals EWSR1-FLI1-driven dysregulation of heparan sulfate proteoglycan metabolism and ERK signaling in developing tumors [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: Sarcomas; 2022 May 9-12; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2022;28(18_Suppl):Abstract nr PR009.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,260
Tête enseignante GPT0,464
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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