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Enregistrement W4296635294 · doi:10.1093/jas/skac247.459

PSIV-A-13 Estimation of Nellore Genetic Contribution Over Certified Angus Beef Sold in Brazil

2022· article· en· W4296635294 sur OpenAlexaff
Cris Luana Castro de Nunes, Fabyano Fonseca e Silva, Renata Veroneze, Marcio Souza de Duarte, Simone Eliza Facioni Guimarães, Luiz Antônio Josakian, Henrique Torres Ventura, M. L. Chizzotti

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIdentification and Quantification in Food
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBreedSingle-nucleotide polymorphismAnimal scienceBeef cattlePurebredGenotypingVeterinary medicineBiotechnologyGenotypeGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Meat traceability and certification increase consumers’ confidence in making purchasing decisions. In Brazil, certified Angus beef follows specific regulation, which requires a minimum of 50% of Angus genome in its breed composition to be commercialized as certified Angus beef. Because the majority of the beef produced in Brazil is Nellore-based, the objective of this study was to estimate the Nellore genetic contribution over certified Angus beef sold in Brazil using genetic traceability. Two hundred sixty-one certified Angus ribeye steaks were obtained from four different brands in commercial establishments. DNA extraction and genotyping were performed for each sample. Genotype data from purebred Angus and Nellore were also available, generating three datasets: meat samples, Angus, and Nellore. Samples and single nucleotide polymorphism (SNP) markers with call rate lower than 0.90 and duplicated samples were excluded from the analysis for each group. Thus, 75,242 SNPs and 99 samples were unique and remained in the meat sample group. For the genotyped reference groups, Angus had 34,586 SNPs and 71 samples while Nellore had 743,665 SNPs and 1,931 samples. The software Admixture were used for the genetic composition prediction using only SNPs in common across the three groups (29563 SNPs). On average, meat samples presented 57% and 43% of Angus and Nellore genome composition, respectively, with proportions ranging from 28% to 87% of Angus genome. Additionally, a principal components analysis showed a clear separation between Nellore and Angus population, whereas the evaluated meat samples were clustered between the two groups. In conclusion, certified Angus beef sold in Brazil have a great contribution of Nellore and some samples had lower Angus contribution than the expected by the certification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,367
Score d'incertitude au seuil0,221

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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