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Enregistrement W4296760522 · doi:10.21203/rs.3.rs-1770054/v1

Non-Small-Cell Lung Cancer Promotion by Air Pollutants

2022· preprint· en· W4296760522 sur OpenAlexaff
Charles Swanton, William Hill, Emilia L. Lim, Claudia Lee, Clare E. Weeden, Marcellus Augustine, Kezhong Chen, Feng‐Che Kuan, Fabio Marongiu, Edward J. Evans, D. J. Moore, Felipe Silva Rodrigues, Febe van Maldegem, Jesse Boumelha, Selvaraju Veeriah, Andrew Rowan, Cristina Naceur‐Lombardelli, Takahiro Karasaki, Monica Sivakumar, Deborah R. Caswell, A. Nagano, Min Hyung Ryu, Ryan D. Huff, Shijia Li, Alastair Magness, Alejandro Suárez‐Bonnet, Simon L. Priestnall, Margreet Lüchtenborg, Katrina Lavelle, Joanna Pethick, Steven J. Hardy, Fiona E. McRonald, Meng‐Hung Lin, Clara I. Troccoli, Moumita Ghosh, York E. Miller, Daniel T. Merrick, Robert L. Keith, Maise Al Bakir, Chris Bailey, Lao H. Saal, Yilun Chen, Anthony M. George, Chris Abbosh, Nnennaya Kanu, Se‐Hoon Lee, Nicholas McGranahan, Chistine Berg, Eva Grönroos, Julian Downward, Tyler Jacks, Christopher Carlsten, Ilaria Malanchi, Allan Hackshaw, Kevin Litchfield, Mariam Jamal‐Hanjani, James DeGregori

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAir Quality and Health Impacts
Établissements canadiensVancouver Coastal Health Research InstituteVancouver Coastal Health
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Human Genome Research InstituteJapan Society for the Promotion of ScienceLUNGevity FoundationEntertainment Industry FoundationMinistry of Science and ICT, South KoreaStand Up To CancerNational Research Foundation of KoreaMedical Research CouncilPeking University People's HospitalNational Natural Science Foundation of ChinaRoyal SocietyKorea Health Industry Development InstituteChang Gung Medical FoundationNational Institute for Health and Care ResearchPeking UniversityWellcome TrustUniversity College LondonCancer Research UKAmerican Association for Cancer ResearchNational Research FoundationChinese Academy of Medical SciencesFrancis Crick InstituteRosetrees TrustEuropean CommissionBreast Cancer Research Foundation
Mots-clésPollutantPromotion (chess)Lung cancerAir pollutantsEnvironmental scienceBusinessEnvironmental healthMedicineOncologyPolitical scienceAir pollutionBiologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Environmental carcinogenic exposures are major contributors to global disease burden yet how they promote cancer is unclear. Over 70 years ago, the concept of tumour promoting agents driving latent clones to expand was first proposed. In support of this model, recent evidence suggests that human tissue contains a patchwork of mutant clones, some of which harbour oncogenic mutations, and many environmental carcinogens lack a clear mutational signature. We hypothesised that the environmental carcinogen, <2.5μm particulate matter (PM2.5), might promote lung cancer promotion through non-mutagenic mechanisms by acting on pre-existing mutant clones within normal tissues in patients with lung cancer who have never smoked, a disease with a high frequency of EGFR activating mutations. We analysed PM2.5 levels and cancer incidence reported by UK Biobank, Public Health England, Taiwan Chang Gung Memorial Hospital (CGMH) and Korean Samsung Medical Centre (SMC) from a total of 463,679 individuals between 2006-2018. We report associations between PM2.5 levels and the incidence of several cancers, including EGFR mutant lung cancer. We find that pollution on a background of EGFR mutant lung epithelium promotes a progenitor-like cell state and demonstrate that PM accelerates lung cancer progression in EGFR and Kras mutant mouse lung cancer models. Through parallel exposure studies in mouse and human participants, we find evidence that inflammatory mediators, such as interleukin-1ꞵ, may act upon EGFR mutant clones to drive expansion of progenitor cells. Ultradeep mutational profiling of histologically normal lung tissue from 247 individuals across 3 clinical cohorts revealed oncogenic EGFR and KRAS driver mutations in 18% and 33% of normal tissue samples, respectively. These results support a tumour-promoting role for PM acting on latent mutant clones in normal lung tissue and add to evidence providing an urgent mandate to address air pollution in urban areas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,095
Tête enseignante GPT0,431
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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