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Enregistrement W4296935228 · doi:10.1016/j.isci.2022.105210

Genome-wide analyses identify SCN5A as a susceptibility locus for premature atrial contraction frequency

2022· article· en· W4296935228 sur OpenAlexaff
Sébastien Thériault, Medea Imboden, Mary L. Biggs, Thomas R. Austin, Stefanie Aeschbacher, Emmanuel Schaffner, Jennifer A. Brody, Traci M. Bartz, Martin Risch, Kirsten Grossmann, Henry J. Lin, Elsayed Z. Soliman, Wendy S. Post, Lorenz Risch, José Eduardo Krieger, Alexandre C. Pereira, Susan R. Heckbert, Nona Sotoodehnia, Nicole Probst‐Hensch, David Conen

Notice bibliographique

RevueiScience · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensMcMaster UniversityPopulation Health Research InstituteUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute on AgingNational Institutes of HealthNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungBroad InstituteWellcome Trust
Mots-clésLocus (genetics)Premature atrial contractionBiologyMedicineGeneticsComputational biologyCardiologyGeneAtrial fibrillation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Premature atrial contractions (PACs) are frequently observed on electrocardiograms and are associated with increased risks of atrial fibrillation (AF), stroke, and mortality. In this study, we aimed to identify genetic susceptibility loci for PAC frequency. We performed a genome-wide association study meta-analysis with PAC frequency obtained from ambulatory cardiac monitoring in 4,831 individuals of European ancestry. We identified a genome-wide significant locus at the SCN5A gene. The lead variant, rs7373862, located in an intron of SCN5A, was associated with an increase of 0.12 [95% CI 0.08–0.16] standard deviations of the normalized PAC frequency per risk allele. Among genetic variants previously associated with AF, there was a significant enrichment in concordance of effect for PAC frequency (n = 73/106, p = 5.1 × 10−5). However, several AF risk loci, including PITX2, were not associated with PAC frequency. These findings suggest the existence of both shared and distinct genetic mechanisms for PAC frequency and AF.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,921
Score d'incertitude au seuil0,404

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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