MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4297324028 · doi:10.1101/2022.09.25.509397

Quantifying Spatio-Temporal Overlap of Invasive Wild Pigs and Domestic Pig Farms as a Proxy for Potential Disease Transmission Risk

2022· preprint· en· W4297324028 sur OpenAlexaffabout
Ruth A. Aschim, Ryan K. Brook

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Disease Management and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWild boarDomestic pigWildlifeLivestockChronic wasting diseasePig farmingGeographyDomesticationWildlife diseaseVeterinary medicineTransmission (telecommunications)BiologySpatial epidemiologyEcologyAnimal scienceDiseaseForestryAnimal productionMedicineEpidemiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Direct and indirect interactions between livestock and free-ranging wildlife creates important risks to animal health and agricultural productivity. The interface between newly established and rapidly spreading invasive wild pigs and the 2,549 domestic pig farms on the Prairie Provinces of western Canada has created important but poorly understood disease transmission risks. We mapped the spatial overlap of wild and domestic pigs to identify the areas of highest risk and associated distribution of diseases of concern using databases of wild pig occurrences and domestic pig farm locations. We also examined spatial and temporal overlap at the individual farm scale using GPS collared invasive wild pigs. Across the provinces of Alberta, Saskatchewan, and Manitoba, spatial overlap of invasive wild pigs with all combined, large-scale domestic pig farms, small-scale domestic pig farms, and domestic wild boar farms was 21%, 21%, 21%, and 53%. Invasive wild pig locations were significantly closer to domestic pig farms and domestic wild boar farms compared to random points on the landscape. The number of wild pig occurrences was greatest within 20 km of domestic pig farms and decreased linearly as distance increased. The Canadian distribution of wild pigs had considerable spatial overlap with recent areas detected with bovine tuberculosis (6,002 km 2 ) in livestock and wildlife and Chronic Wasting Disease (156,159 km 2 ) in wildlife, including mule deer, white-tailed deer, elk, and moose. The single best predictor of invasive wild pig occurrences across the landscape was close proximity to current or recently past existing domestic wild boar farms. The distance of GPS- collared wild pigs was significant for sex, farm type, month, and season and in southeastern Saskatchewan, average distance to domestic pig farms was 5.3 km. The weighted sum of cover type proportions, wild pig distance to domestic pig and wild boar farms, farm type, and farm density identified the relative risk of wild pig presence associated to each domestic pig farm occupied watershed. Risk was highest for small-scale domestic pig farms and lowest for large- scale domestic pig farms. Our findings highlight important potential routes for disease transmission at the invasive wild pig-domestic pig interface and identify areas where biosecurity improvements are urgently needed. While complete eradication of invasive wild pigs in Canada is no longer achievable, improved passive and active monitoring and removal of wild pigs is critical, especially where risks to domestic pig herds is highest.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,273
Score d'incertitude au seuil0,543

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetAnimal Disease Management and EpidemiologyTravaux en français237 207