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Enregistrement W4297475217 · doi:10.1002/pro.4440

A genetically encoded far‐red fluorescent calcium ion biosensor derived from a biliverdin‐binding protein

2022· article· en· W4297475217 sur OpenAlex
Rina Hashizume, Hajime Fujii, Sohum Mehta, Keisuke Ota, Yong Qian, Wenchao Zhu, Mikhail Drobizhev, Yusuke Nasu, Jin Zhang, Haruhiko Bito, Robert E. Campbell

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueProtein Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePhotoreceptor and optogenetics research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteJapan Society for the Promotion of ScienceCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of California, San DiegoNational Institutes of HealthToyota Physical and Chemical Research InstituteHitachi Global FoundationNakatani Foundation for Advancement of Measuring Technologies in Biomedical EngineeringNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesUniversity of TokyoAstellas Foundation for Research on Metabolic DisordersAstellas PharmaUniversity of AlbertaMontana State UniversityNational Institute of Neurological Disorders and StrokeKato Memorial Bioscience FoundationJapan Agency for Medical Research and DevelopmentTakeda Science Foundation
Mots-clésBiliverdinFluorescenceGreen fluorescent proteinBiophysicsFar-redFluorescent proteinCalcium imagingProtein engineeringIn vivoChemistryCalciumBiochemistryBiologyOpticsHemeGeneticsGenePhysicsRed lightBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Far‐red and near‐infrared (NIR) genetically encoded calcium ion (Ca 2+ ) indicators (GECIs) are powerful tools for in vivo and multiplexed imaging of neural activity and cell signaling. Inspired by a previous report to engineer a far‐red fluorescent protein (FP) from a biliverdin (BV)‐binding NIR FP, we have developed a far‐red fluorescent GECI, designated iBB‐GECO1, from a previously reported NIR GECI. iBB‐GECO1 exhibits a relatively high molecular brightness, an inverse response to Ca 2+ with Δ F / F min = −13, and a near‐optimal dissociation constant ( K d ) for Ca 2+ of 105 nM. We demonstrate the utility of iBB‐GECO1 for four‐color multiplexed imaging in MIN6 cells and five‐color imaging in HEK293T cells. Like other BV‐binding GECIs, iBB‐GECO1 did not give robust signals during in vivo imaging of neural activity in mice, but did provide promising results that will guide future engineering efforts. Significance Genetically encoded calcium ion (Ca 2+ ) indicators (GECIs) compatible with common far‐red laser lines (~630–640 nm) on commercial microscopes are of critical importance for their widespread application to deep‐tissue multiplexed imaging of neural activity. In this study, we engineered a far‐red excitable fluorescent GECI, designated iBB‐GECO1, that exhibits a range of preferable specifications such as high brightness, large fluorescence response to Ca 2+ , and compatibility with multiplexed imaging in mammalian cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle