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Enregistrement W4297491644 · doi:10.1186/s12014-022-09371-z

The dynamic changes and sex differences of 147 immune-related proteins during acute COVID-19 in 580 individuals

2022· article· en· W4297491644 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueClinical Proteomics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensMcGill Genome CentreUniversité de MontréalMcGill University Health CentreCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéGénome QuébecPublic Health Agency of CanadaMcGill UniversityFondation de l'Hôpital général juifCanadian Institutes of Health ResearchCompute CanadaNational Institutes of HealthJapan Society for the Promotion of ScienceCancer Research UKTD BankJewish General HospitalPublic Health AgencyNational Cancer InstituteamfAR, The Foundation for AIDS Research
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)ProteomicsImmune system2019-20 coronavirus outbreakSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)MedicineImmunologyPandemicBiologyComputational biologyBioinformaticsVirologyInternal medicineDiseaseGeneticsOutbreakInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Severe COVID-19 leads to important changes in circulating immune-related proteins. To date it has been difficult to understand their temporal relationship and identify cytokines that are drivers of severe COVID-19 outcomes and underlie differences in outcomes between sexes. Here, we measured 147 immune-related proteins during acute COVID-19 to investigate these questions. METHODS: We measured circulating protein abundances using the SOMAscan nucleic acid aptamer panel in two large independent hospital-based COVID-19 cohorts in Canada and the United States. We fit generalized additive models with cubic splines from the start of symptom onset to identify protein levels over the first 14 days of infection which were different between severe cases and controls, adjusting for age and sex. Severe cases were defined as individuals with COVID-19 requiring invasive or non-invasive mechanical respiratory support. RESULTS: ). Three clusters were formed by 108 highly correlated proteins that replicated in both cohorts, making it difficult to determine which proteins have a true causal effect on severe COVID-19. Six proteins showed sex differences in levels over time, of which 3 were also associated with severe COVID-19: CCL26, IL1RL2, and IL3RA, providing insights to better understand the marked differences in outcomes by sex. CONCLUSIONS: Severe COVID-19 is associated with large changes in 69 immune-related proteins. Further, five proteins were associated with sex differences in outcomes. These results provide direct insights into immune-related proteins that are strongly influenced by severe COVID-19 infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,042
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,966

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,042
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,002
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,435
Écart entre enseignants0,373 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle