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Enregistrement W4297811907 · doi:10.5252/cryptogamie-mycologie2022v43a5

Disentangling Cryptic Species in the Marasmius haematocephalus (Mont.) Fr. and M. siccus (Schwein.) Fr. Species Complexes (Agaricales, Basidiomycota)

2022· article· en· W4297811907 sur OpenAlexaff
Jadson José Souza de Oliveira, Marina Capelari, Simona Margaritescu, Jean‐Marc Moncalvo

Notice bibliographique

RevueCryptogamie Mycologie · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensUniversity of TorontoRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAgaricalesBiologyBasidiomycotaPantropicalBotanyTaxonomy (biology)Genus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Démêler les espèces cryptiques dans les complexes d'espèces Marasmius haematocephalus (Mont.) Fr. et M. siccus (Schwein.) Fr. (Agaricales, Basidiomycota). Marasmius haematocephalus (Mont.) Fr. et M. siccus (Schwein.) Fr. (ser. Haematocephali) ont été respectivement décrits du sud-est du Brésil et de l'est des États-Unis, signalés par la suite comme pantropicaux et pantempérés. Dans des études phylogénétiques récentes, ils semblent étroitement liés dans leurs concepts généraux et au moins M. haematocephalus est suggéré comme un complexe d'espèces. Nous avons cherché à déterminer ici si M. haematocephalus est ou non pantropical et si M. siccus est ou non pantempéré. Les phylogénies combinées nrITS + nrLSU et nrITS + rpb2 + ef1-α ont été reconstruites dans les analyses de vraisemblance maximale et bayésiennes et intégrées avec des données morphologiques détaillées. Les résultats ont indiqué que M. haematocephalus ‘sensu stricto’ (s. str.) n’est pas pantropical mais tout au plus néotropical, avec des espèces proches en Afrique tropicale et en Indo-Malaisie. De façon similaire, M. siccus s. str. est tout au plus néarctique, avec des espèces proches dans le paléarctique tempéré. Pour l’instant, on peut reconnaître environ 23 espèces dans les complexes M. haematocephalus et M. siccus, dont quatre sont décrites ici comme nouvelles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,520
Score d'incertitude au seuil0,989

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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