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Enregistrement W4297993336 · doi:10.17615/hs58-7865

A Low-Frequency Inactivating AKT2 Variant Enriched in the Finnish Population Is Associated With Fasting Insulin Levels and Type 2 Diabetes Risk

2017· article· en· W4297993336 sur OpenAlexfundno aff
Benjamin M. Neale, Hanna E. Abboud, William R. Scott, Goo Jun, Paul W. Franks, Mark I. McCarthy, Dylan Hodgkiss, Vidya S. Farook, Ching‐Yu Cheng, George Grant, Weiping Jia, Todd D. Green, Christian Fuchsberger, Herman A. Taylor, Michael Griswold, Torsten Lauritzen, Markku Laakso, Richard N. Bergman, Manuel A. Rivas, James Wilson, Andres Metspalu, Robert C. Onofrio, Uzma Afzal, Maggie Ng, Mark Seielstad, Lori L. Bonnycastle, Gemma Buck, Peter M. Nilsson, Lars Lind, Jinyan Huang, Andrew T. Hattersley, Kyle J. Gaulton, Narisu Narisu, Aarno Palotie, Martina Müller‐Nurasyid, Michael Boehnke, Thomas Wieland, Eleftheria Zeggini, Jason P. Carey, Jennifer E. Below, Tune H. Pers, Michael Roden, Mark J. Daly, Mark O. Goodarzi, Shyong Tai, Ol L. E Mel Ander, Martin Hrabě de Angelis, Joshua D. Smith, Jaana Lindström, Harald Grallert, Ashish Kumar, Matt J. Neville, Gregory J. Wilson, Andrew D. Morris, Seppo K. Koskinen, Adolfo Correa, Giriraj R. Chandak, Marie Loh, Jason Flannick, Loukas Moutsianas, Ravindranath Duggirala, Barry I. Freedman, Christopher Hartl, Ronald C.W. Ma, James B. Meigs, Robert A. Scott, Benjamin Lehne, Mark Walker, Karen L. Mohlke, Ivan Brandslund, Annette Peters, Oluf Pedersen, Johan G. Eriksson, Xueling Sim, Dwaipayan Bharadwaj, J Lévy, Kat Har I Ne R. Owen, Yossi Farjoun, Richard M. Watanabe, Anne Jackson, David Aguilar, Jennifer Wessel, Claudia Langenberg, Lili Milani, Rector Arya, Thomas Meitinger, Anette P. Gjesing, Massimo Mangino, Audrey Y. Chu, Ralph A. DeFronzo, Marit E. Jørgensen, Veikko Salomaa, Manjinder S. Sandhu, Teemu Kuulasmaa, Leif Groop, Stacey Gabriel, Mauricio O. Carneiro, Dorota Pasko, Liisa Hakaste, Alex S. F. Doney, Kerrin S. Small, Kathleen Stirrups, David Altshuler, Toni I. Pollin, Leena Kinnunen, Amy J. Swift, Gonçalo R. Abecasis, Richard D. Pearson, Jacqueline I. Goldstein, Jacquelyn Murphy, Joseph Trakalo, Torben Hansen, João Fadista, Pablo Cingolani, Hae Kyung Im, Edmund Chan, Philippe Froguel, Frank B. Hu, Craig L. Hanis, Fredrik Karpe, Yik Ying Teo, Jasmi Na Kravi C, Khalid Shakir, Heikki A. Koistinen, Benjamin Gläser, Eric Banks, Jared Maguire, Liming Liang, Christopher P. Jenkinson, Josée Dupuis, Matti Uusitupa, Peter Donnelly, Jaakko Tuomilehto, Tien Yin Wong, Reedik Mägi, Tin Aung, Samuli Ripatti, Claes Ladenvall, Gil Atzmon, Ying Wu, Ana Viñuela, Timothy D. Spector, Qibin Qi, Chiea Chuen Khor, Juliana C.N. Chan, Tim M. Strom, Andrew R. Wood, John R. B. Perry, Torben Jørgensen, Eric R. Gamazon, Barbara Thorand, Stephen P. O’rahilly, Andrew Brown, Alisa K. Manning, Rainer Rauramaa, Evelin Mihailov, Jessica A. Gasser, Sobha Puppala, Cheng Hu, Mark A. DePristo, Anna L. Gloyn, Terho Lehtimäki, Allan Linneberg, Nicholas J. Wareham, Nir Barzilai, Heikki Oksa, José C. Florez, Taesung Park, Robert Sladek, Inês Barroso, Hyun Min Kang, Johanna Kuusisto, Erik Ingelsson, Tanya M. Teslovich, John Blangero, Francis S. Collins, Olov Rolandsson, Antero Kesäniemi, Christa Meisinger, Ann‐Christine Syvänen, Thomas Illig, Bok‐Ghee Han, Donna M. Lehman, Yoon Shin Cho, Andrew P. Morris, Yu‐Hui Chen, Jong‐Young Lee, Olli Raitakari, David Buck, Antti Jula, Jennifer Kriebel, J. F. Scott, Panos Deloukas, Joanne E. Curran, Jobanpreet Sehmi, Jianjun Li U, Gil McVean, Shaun Purcell, Solomon K. Musani, Tibor V. Varga, Nancy J. Cox, Bo Isomaa, Laura J. Scott, Martijn van de Bunt, Thomas W. Blackwell, Heather M. Stringham, Clement Ma, Timo A. Lakka, John C. Chambers, Tõnu Esko, Christian Gieger, Mette Hollensted, Neil R. Robertson, Peter S. Chines, Dorairaj Prabhakaran, Christopher J. Groves, Cramer Christensen, Timothy R. Fennell, Nikhil Tandon, Marju Orho‐Melander, Graeme I. Bell, Lars Lannfelt, Farook Thameem, Pierre Fontanillas, Jeroen R. Huyghe, Gabriela L. Surdulescu, Jaspal S. Kooner, Kee Seng Chia, Sharon P. Fowler, Nigel W. Rayner, Niels Grarup, Inga Prokopenko, Daniel E. Hale, Paul Elliott, Shah B. Ebrahim, Christine Blancher, Wei Yen Lim, Suzanne B.R. Jacobs, Annemari Käräjämäki, Anubha Mahajan, Cecilia M. Lindgren, Taru Tukiainen, Adam E. Locke, Donald W. Bowden, Johanne Marie Justesen, Timothy M. Frayling, Heather M. Highland, Jette Bork‐Jensen, Anders H. Rosengren, Alena Stan cáková, Satish Kumar, Noël P. Burtt, Konstantin Strauch, Lu Qi, Thomas Schwarzmayr, Ryan Poplin, Tasha E. Fingerlin

Notice bibliographique

RevueUniversity of Southern Denmark Research Portal (University of Southern Denmark) · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiovascular Function and Risk Factors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiomedical Research CouncilKorea Centers for Disease Control and PreventionMedical Research CouncilCenters for Disease Control and PreventionDiabetesliittoSydäntutkimussäätiöEesti TeadusagentuurSamfundet FolkhälsanTartu ÜlikoolEmil Aaltosen SäätiöHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriAtlantic Canada Opportunities AgencyJuho Vainion SäätiöSuomen KulttuurirahastoAugustinus FondenHelsefondenBundesministerium für Bildung und ForschungKelaEuropean CommissionFolkhälsanin TutkimussäätiöBritish Heart FoundationSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådFoundation for Cardiovascular ResearchFinska LäkaresällskapetSihtasutus ArchimedesJalmari ja Rauha Ahokkaan SäätiöDiabetestutkimussäätiöWellcome TrustHjerteforeningenDanmarks Frie ForskningsfondHelmholtz Zentrum MünchenAmerican Diabetes Association
Mots-clésType 2 diabetesInsulinMedicineDiabetes mellitusPopulationInternal medicineEndocrinologyEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To identify novel coding association signals and facilitate characterization of mechanisms influencing glycemic traits and type 2 diabetes risk, we analyzed 109,215 variants derived from exome array genotyping together with an additional 390,225 variants from exome sequence in up to 39,339 normoglycemic individuals from five ancestry groups. We identified a novel association between the coding variant (p.Pro50Thr) in AKT2 and fasting insulin, a gene in which rare fully penetrant mutations are causal for monogenic glycemic disorders. The low-frequency allele is associated with a 12% increase in fasting plasma insulin (FI) levels. This variant is present at 1.1% frequency in Finns but virtually absent in individuals from other ancestries. Carriers of the FI-increasing allele had increased 2-hour insulin values, decreased insulin sensitivity, and increased risk of type 2 diabetes (odds ratio=1.05). In cellular studies, the AKT2-Thr50 protein exhibited a partial loss of function. We extend the allelic spectrum for coding variants in AKT2 associated with disorders of glucose homeostasis and demonstrate bidirectional effects of variants within the pleckstrin homology domain of AKT2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,131
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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