MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4298225535 · doi:10.17615/q3bp-3c89

An Orally Bioavailable Chemical Probe of the Lysine Methyltransferases EZH2 and EZH1

2020· article· en· W4298225535 sur OpenAlexfundno aff
Xi‐Ping Huang, Feng Liu, Masoud Vedadi, Kyle D. Konze, C.H. Arrowsmith, Gang Greg Wang, Lindsey I. James, Alice Jiang, Jian Jin, Peter J. Brown, Anqi Ma, Marie Rougié, E. Kuznetsova, Christopher J. MacNevin, Trevor Parton, Bryan L. Roth, Cen Gao, Jacqueline L. Norris, Fengling Li, Samantha G. Pattenden, Klaus M. Hahn, Stephen V. Frye, Dalia Barsyte-Lovejoy

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteEli Lilly CanadaUniversity of North Carolina at Chapel HillOntario GenomicsNational Institutes of HealthMinistero dello Sviluppo EconomicoOntario Ministry of Economic Development and InnovationOntario Genomics InstituteGenome CanadaWellcome TrustGlaxoSmithKlinePfizerEli Lilly and Company
Mots-clésMethyltransferaseEZH2BioavailabilityLysineChemistryMethylationPharmacologyBiochemistryBiologyAmino acidDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

EZH2 or EZH1 is the catalytic subunit of the polycomb repressive complex 2 that catalyzes methylation of histone H3 lysine 27 (H3K27). The trimethylation of H3K27 (H3K27me3) is a transcriptionally repressive post-translational modification. Overexpression of EZH2 and hypertrimethylation of H3K27 have been implicated in a number of cancers. Several selective inhibitors of EZH2 have been reported recently. Herein we disclose UNC1999, the first orally bioavailable inhibitor that has high in vitro potency for wild-type and mutant EZH2 as well as EZH1, a closely related H3K27 methyltransferase that shares 96% sequence identity with EZH2 in their respective catalytic domains. UNC1999 was highly selective for EZH2 and EZH1 over a broad range of epigenetic and non-epigenetic targets, competitive with the cofactor SAM, and non-competitive with the peptide substrate. This inhibitor potently reduced H3K27me3 levels in cells and selectively killed diffused large B cell lymphoma cell lines harboring the EZH2Y641N mutant. Importantly, UNC1999 was orally bioavailable in mice, making this inhibitor a valuable tool for investigating the role of EZH2 and EZH1 in chronic animal studies. We also designed and synthesized UNC2400, a close analog of UNC1999 with >1,000-fold lower potency than UNC1999 as a negative control for cell-based studies. Finally, we created a biotin-tagged UNC1999 (UNC2399) which enriched EZH2 in pull-down studies, and a UNC1999 – dye conjugate (UNC2239) for co-localization studies with EZH2 in live cells. Taken together, these compounds represent a set of useful tools for the biomedical community to investigate the role of EZH2 and EZH1 in health and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFigshareMême sujetEpigenetics and DNA MethylationTravaux en français237 207