Molecular Investigation of Fowl Aviadenovirus in Broiler Flocks in North Sinai Province
Notice bibliographique
Résumé
Fowl aviadenoviruses (FAdV) have gained increasing attention recently in Egypt and worldwide. They are the primary etiology of many widespread diseases. Among these diseases, inclusion body hepatitis (IBH). Many outbreaks of IBH have been documented in the last few years across the country, causing significant economic losses to the Egyptian poultry sector. This study was established to identify FAdV from field outbreaks of IBH in commercial broiler farms in North Sinai province during the period from May 2016 till December 2017. Affected birds lie on their sides with reduced feed intake, depression, ruffled feathers, pale comb and facial skin. While the most common postmortem lesions were hydropericardium, yellowish enlarged liver with ecchymotic hemorrhages, pancreatitis, and enteritis. Histopathological examination of liver samples collected at different stages of infection showed multifocal necrosis, extensive congestion with inflammatory cellular infiltration. The presence of intranuclear inclusion bodies (INIB) was variable among samples. FAdV were detected in liver samples from eleven flocks out of the fourteen examined by real-time polymerase chain reaction (real-time PCR) using commercial kits with differences in viral load among samples. DNA samples from four flocks that exhibited the highest fluorescence curve altitudes were subjected to conventional PCR targeting the hexon loop-1 gene for genetic characterization purpose. Sequencing of the four specific PCR products and phylogenetic analysis of the sequences showed that the four isolates (Sin-1, Sin-2, Sin-3, and Sin-4) were clustered into serotype-2, FAdV-D species. The strains in this study are sharing 99.82%, 99.63%,99.60%, and 98.2% nucleotide identity with FADV-2 (species D) strains from Israel, Japan, Egypt, and Canada, respectively. This study provides epidemiological data that could be useful in the design of an appropriate prevention strategy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».