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Enregistrement W4299598833 · doi:10.17615/14mj-1p71

CYP24A1 variant modifies the association between use of oestrogen plus progestogen therapy and colorectal cancer risk

2020· article· en· W4299598833 sur OpenAlexfundno aff
Shuji Ogino, Mengmeng Du, Jenny Chang‐Claude, Robert W. Haile, Fredrick R. Schumacher, Noralane M. Lindor, Sonja I. Berndt, Martha L. Slattery, Tabitha A. Harrison, John L. Hopper, Mathieu Lemire, Mark Thornquist, Michelle Cotterchio, Katja Butterbach, Marc J. Gunter, Robert E. Schoen, Greg S. Warnick, Stephen N. Thibodeau, Jane C. Figueiredo, Andrew T. Chan, Michael Hoffmeister, Deanna L. Stelling, Stephen J. Chanock, Laurence N. Kolonel, Mark A. Jenkins, Hermann Brenner, Graham Casey, Stephanie A. Rosse, Brent W. Zanke, Cornelia M. Ulrich, Emily White, Jian Ping Gong, Peter T. Campbell, Jennifer S Lin, Charles S. Fuchs, Polly A. Newcomb, John A. Baron, David Duggan, Conghui Qu, Xabier García‐Albéniz, Li Hsu, Richard B. Hayes, Loı̈c Le Marchand, Shuo Jiao, Thomas J. Hudson, Bette J. Caan, Carolyn M. Hutter, Bethann M. Pflugeisen, Anja Rudolph, Edward L. Giovannucci, Christopher S. Carlson, John D. Potter, James Gauderman, Yi Lin, Daniela Seminara

Notice bibliographique

RevueUNC Libraries · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal Regulation and Hypertension
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteDamon Runyon Cancer Research FoundationCanadian Institutes of Health ResearchBundesministerium für Bildung und ForschungDeutsche ForschungsgemeinschaftCanadian Cancer Society Research InstituteU.S. Department of Health and Human ServicesNational Institutes of HealthSociedad Española de Oncología MédicaMinisterio de Economía y CompetitividadOntario Institute for Cancer ResearchNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesJohns Hopkins UniversityDivision of Cancer Prevention, National Cancer Institute
Mots-clésProgestogenCYP24A1Colorectal cancerMedicineOncologyInternal medicineCancerEstrogenVitamin D and neurologyCalcitriol receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Menopausal hormone therapy (MHT) use has been consistently associated with a decreased risk of colorectal cancer (CRC) in women. Our aim was to use a genome-wide gene-environment interaction analysis to identify genetic modifiers of CRC risk associated with use of MHT. METHODS: We included 10 835 postmenopausal women (5419 cases and 5416 controls) from 10 studies. We evaluated use of any MHT, oestrogen-only (E-only) and combined oestrogen-progestogen (E+P) hormone preparations. To test for multiplicative interactions, we applied the empirical Bayes (EB) test as well as the Wald test in conventional case-control logistic regression as primary tests. The Cocktail test was used as secondary test. RESULTS: The EB test identified a significant interaction between rs964293 at 20q13.2/CYP24A1 and E+P (interaction OR (95% CIs)=0.61 (0.52-0.72), P=4.8 × 10(-9)). The secondary analysis also identified this interaction (Cocktail test OR=0.64 (0.52-0.78), P=1.2 × 10(-5) (alpha threshold=3.1 × 10(-4)). The ORs for association between E+P and CRC risk by rs964293 genotype were as follows: C/C, 0.96 (0.61-1.50); A/C, 0.61 (0.39-0.95) and A/A, 0.40 (0.22-0.73), respectively. CONCLUSIONS: Our results indicate that rs964293 modifies the association between E+P and CRC risk. The variant is located near CYP24A1, which encodes an enzyme involved in vitamin D metabolism. This novel finding offers additional insight into downstream pathways of CRC etiopathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,224

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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