Genomic and Phenotypic Variability of Mycobaterium avium Subspecies
Notice bibliographique
Résumé

 
 
 Introduction: Mycobacterium avium complex consists of M. intracellulare and the subspecies of M. avium subsp. avium, M. avium subsp. paratuberculosis and M. avium subsp. hominissuis. Despite their taxonomic relationship, these subspecies are organisms with distinct phenotypes, ranging from environmental bacteria that cause infections in immunocompromised hosts to pathogens targeting birds and ruminants. The reasons for the variable pathogenicity and host range of M. avium subspecies are not known. We hypothesize that genotypic differences between M. avium subsp. avium and M. avium subsp. paraturberculosis can explain different pathogenic outcomes. Methods: We used tri-genomic comparisons to look for DNA fragments unique to each subspecies. We also used an acute model of mouse infection to determine different phenotypic outcomes in response to infection with different Mycobacterium subspecies. results: Through tri-genomic comparisons we identified genetic regions of interest that may contain genes to explain phenotypic or pathogenic differences among subspecies. In an 8 week course infection, mice infected with M. avium subspecies avium had the highest bacterial burden in their spleens and livers. at the same time, mice infected with M. avium subspecies paraturberculosis had the lowest bacterial burden. discussion: Differences in the genomic sequences of the M. avium subspecies suggests that these sequences encode pathogenic factors. Consequently, this study shows that the sequencing of M. avium subspecies genomes can be useful for predicting and explaining variation in pathogenesis.
 
 
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,012 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,004 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».