MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4300816851 · doi:10.2337/db22-0121

Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Role for Reactive Oxygen Species and Peroxiredoxins in Fatty Acid–Induced Rat β-Cell Proliferation

2022· article· en· W4300816851 sur OpenAlexafffund
Alexis Vivoli, Julien Ghislain, Ali Filali‐Mouhim, Zuraya Elisa Angeles, Anne‐Laure Castell, Robert Sladek, Vincent Poitout

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensMcGill Genome CentreUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésCell growthBiologyPeroxiredoxinReactive oxygen speciesCell biologyTranscriptomeCellGlucose homeostasisBiochemistryGene expressionInsulinGeneEndocrinologyInsulin resistance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The functional mass of insulin-secreting pancreatic β-cells expands to maintain glucose homeostasis in the face of nutrient excess, in part via replication of existing β-cells. Type 2 diabetes appears when these compensatory mechanisms fail. Nutrients including glucose and fatty acids are important contributors to the β-cell compensatory response, but their underlying mechanisms of action remain poorly understood. We investigated the transcriptional mechanisms of β-cell proliferation in response to fatty acids. Isolated rat islets were exposed to 16.7 mmol/L glucose with or without 0.5 mmol/L oleate (C18:1) or palmitate (C16:0) for 48 h. The islet transcriptome was assessed by single-cell RNA sequencing. β-Cell proliferation was measured by flow cytometry. Unsupervised clustering of pooled β-cells identified different subclusters, including proliferating β-cells. β-Cell proliferation increased in response to oleate but not palmitate. Both fatty acids enhanced the expression of genes involved in energy metabolism and mitochondrial activity. Comparison of proliferating versus nonproliferating β-cells and pseudotime ordering suggested the involvement of reactive oxygen species (ROS) and peroxiredoxin signaling. Accordingly, N-acetyl cysteine and the peroxiredoxin inhibitor conoidin A both blocked oleate-induced β-cell proliferation. Our study reveals a key role for ROS signaling through peroxiredoxin activation in oleate-induced β-cell proliferation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDiabetesMême sujetPancreatic function and diabetesTravaux en français237 207