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Enregistrement W4300854205 · doi:10.17615/k3vg-tb84

Genome-wide Association for Major Depression Through Age at Onset Stratification: Major Depressive Disorder Working Group of the Psychiatric Genomics Consortium

2020· article· en· W4300854205 sur OpenAlexfundno aff
Susanne Lucae, Stacy Steinberg, Johannes H. Smit, Tim B. Bigdeli, Kāri Stefánsson, Stefan Kloiber, Dorret I. Boomsma, Robert A. Power, Thorgeir E. Thorgeirsson, Ian J. Deary, Steven P. Hamilton, Katherine E. Tansey, Bertram Müller-Myhsok, Lynsey S. Hall, Patrik K. E. Magnusson, Jianxin Shi, Christel M. Middeldorp, Georg Homuth, Michele L. Pergadia, Gerome Breen, Myrna M. Weissman, Nicholas G. Martin, Lynne J. Hocking, Donald J. MacIntyre, Mikael Landén, Sandra Van der Auwera, Jesper Krogh, Paul Lichtenstein, Enrique Castelao, Douglas F. Levinson, Martin Preisig, Volker Arolt, S. Hong Lee, Pamela A. F. Madden, Sandosh Padmanabhan, Enda M. Byrne, Cathryn M. Lewis, Maren Lang, Brenda W.J.H. Penninx, Engilbert Sigurðsson, David J. Porteous, Jana Strohmaier, Jakob Grove, Dale R. Nyholt, Margarita Rivera, Andrew M. McIntosh, Anders D. Børglum, Hans J. Grabe, Naomi R. Wray, Andreas J. Forstner, Andrew C. Heath, Nick Craddock, Hreinn Stefánsson, Scott D. Gordon, Alexander Viktorin, Henriette N. Buttenschøn, Zoltán Kutalik, Grant W. Montgomery, Michael J. Owen, Alexander Teumer, James B. Potash, Pippa A. Thomson, Yuri Milaneschi, Stephan Ripke, B. Baune, Ian Craig, Stanley I. Shyn, Caroline Hayward, Udo Dannlowski, Patrick F. Sullivan, Franziska Degenhardt, Högni Óskarsson, Blair H. Smith, Ole Mors, Sarah Cohen‐Woods

Notice bibliographique

RevueUNC Libraries · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthStrategic Research CouncilNational Health and Medical Research CouncilAustralian Research CouncilMedical Research CouncilRoy J. and Lucille A. Carver College of Medicine, University of IowaStanley Center for Psychiatric Research, Broad InstituteUniversity of North Carolina at Chapel HillNational Institutes of HealthInstitute of GeneticsUniversität GreifswaldH. Lundbeck A/SChinese Society of Clinical OncologyRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnGöteborgs UniversitetChief Scientist Office, Scottish Government Health and Social Care DirectorateInstitute of Psychiatry, Psychology and Neuroscience, King’s College LondonBundesministerium für Bildung und ForschungHáskóli ÍslandsLandspítali HáskólasjúkrahúsDeutsche ForschungsgemeinschaftNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekQueensland Brain InstituteKarolinska InstitutetUniversity of QueenslandQueensland University of TechnologySchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungUniversity of GlasgowUniversity of New EnglandMassachusetts Institute of TechnologyEuropean Science FoundationInstitut for Klinisk Medicin, Aarhus UniversitetScottish Funding CouncilEuropean CommissionUniversity of AberdeenNational Science FoundationMassachusetts General HospitalUniversidad del AtlánticoAarhus UniversitetScottish GovernmentQIMR Berghofer Medical Research InstituteWellcome TrustKing's College LondonVetenskapsrådetVirginia Commonwealth UniversityCentro de Investigación Biomédica en Red de Salud MentalAarhus UniversitetshospitalUniversidad de GranadaZonMwNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionMenzies Centre for Australian Studies, King's College London, University of LondonFlorida Atlantic UniversityMinistry of Cultural AffairsPhilipps-Universität MarburgCardiff UniversityUniversity of Texas Southwestern Medical CenterCentre for Cognitive Ageing and Cognitive EpidemiologyUniversity of PittsburghNational Institute for Health and Care ResearchBroad InstituteCentre Hospitalier Universitaire VaudoisGlaxoSmithKlineNational Cancer InstituteLundbeckfondenKaiser PermanenteVrije Universiteit AmsterdamStiftelsen för Strategisk ForskningUniversity of Dundee
Mots-clésDepression (economics)GenomicsAssociation (psychology)Genome-wide association studyMajor depressive disorderPsychiatric geneticsPsychiatryGenetic associationPsychologyMedicineGenomeGeneticsBiologyGenotypeGeneSchizophrenia (object-oriented programming)Single-nucleotide polymorphismPsychotherapistCognition

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AbstractBackgroundMajor depressive disorder (MDD) is a disabling mood disorder, and despite a known heritable component, a large meta-analysis of genome-wide association studies revealed no replicable genetic risk variants. Given prior evidence of heterogeneity by age at onset in MDD, we tested whether genome-wide significant risk variants for MDD could be identified in cases subdivided by age at onset.MethodsDiscovery case-control genome-wide association studies were performed where cases were stratified using increasing/decreasing age-at-onset cutoffs; significant single nucleotide polymorphisms were tested in nine independent replication samples, giving a total sample of 22,158 cases and 133,749 control subjects for subsetting. Polygenic score analysis was used to examine whether differences in shared genetic risk exists between earlier and adult-onset MDD with commonly comorbid disorders of schizophrenia, bipolar disorder, Alzheimer's disease, and coronary artery disease.ResultsWe identified one replicated genome-wide significant locus associated with adult-onset (>27 years) MDD (rs7647854, odds ratio: 1.16, 95% confidence interval: 1.11–1.21, p = 5.2 × 10-11). Using polygenic score analyses, we show that earlier-onset MDD is genetically more similar to schizophrenia and bipolar disorder than adult-onset MDD.ConclusionsWe demonstrate that using additional phenotype data previously collected by genetic studies to tackle phenotypic heterogeneity in MDD can successfully lead to the discovery of genetic risk factor despite reduced sample size. Furthermore, our results suggest that the genetic susceptibility to MDD differs between adult- and earlier-onset MDD, with earlier-onset cases having a greater genetic overlap with schizophrenia and bipolar disorder.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,555

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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