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Enregistrement W4300973524 · doi:10.26443/msurj.v12i1.44

Role of Ubiquitin in the Survival of Legionella pneumophila in Eukaryotic Host Cells

2017· article· en· W4300973524 sur OpenAlexafffundabout
Si Jia Wang

Notice bibliographique

RevueMcGill Science Undergraduate Research Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLegionella and Acanthamoeba research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesMcGill University
Mots-clésLegionella pneumophilaEffectorUbiquitinBiologyCell biologyAutophagyLegionellaMicrobiologyVirulenceBacteriaGeneGeneticsApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Eukaryotic cells use essential ubiquitin-mediated pathways in their defense against pathogenic bacteria, such as Legionella pneumophila, the intracellular pathogen of Legionnaire’s disease. Despite the protective role of these pathways, L. pneumophila virulence has evolved to secrete numerous effector proteins involved in co-opting host ubiquitin-mediated processes to facilitate their survival. Many of these effector proteins are of great research interest in the quest to demystify the molecular mechanisms underlying L. pneumophila pathogenesis as the bacterium has a vast repertoire of effector proteins. Methods: Articles were obtained from scientific literature databases such as PubMed and the McGill library. Selected articles provided an overview of the ubiquitination pathway, eukaryotic autophagy, L. pneumophila pathogenesis, and structural and functional analysis of L. pneumophila and other bacterial effectors involved in subverting host ubiquitin systems. Summary: This review discusses the current structural and functional characterization of L. pneumophila protein effectors involved in exploiting host ubiquitin machinery to facilitate intracellular bacterial survival. These protein effectors include those with E3 ubiquitin ligase activity, LubX, AnkB, and SidC, which respectively mediate bacterial nutrient acquisition, temporal regulation of other effectors, and remodelling of the L. pneumophila replicative niche; the SidE family of effectors, which mediates the first novel, single-enzyme ubiquitination pathway and deubiquitination; and ravZ, a protease promoting evasion of host autophagy. However, the exact molecular functions and biological consequences of these effectors as well as the full repertoire of L. pneumophila effectors facilitating ubiquitin-mediated survival still require further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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