AKIR-1 Regulates Proteasome Localization and Function in <i>Caenorhabditis elegans</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Regulated protein clearance is vital for cells to maintain protein homeostasis and the conditions essential for survival. The primary machinery for intracellular protein degradation is the ubiquitin– proteasome system (UPS), by which ubiquitin-tagged proteins are degraded by the proteasome. Proteasomes are present both in the cytoplasm and the nucleus, but the mechanisms coordinating proteasome activity and its subcellular localization in a multicellular organism are still unclear. Here, we identified the nuclear protein-encoding gene akir-1 as a proteasome regulator in a genome-wide Caenorhabditis elegans ( C. elegans ) RNAi screen. We show that the depletion of akir-1 causes accumulation of endogenous polyubiquitinated proteins in the nuclei of intestinal cells, concomitant with slower in vivo proteasomal degradation in this subcellular compartment. Remarkably, the loss of akir-1 does not induce an accumulation of polyubiquitinated proteins in oocyte nuclei, though akir-1 is essential for the nuclear localization of proteasomes in both cell types. We further show that the importin family member ima-3 genetically interacts with akir-1 , and affects subcellular distribution of polyubiquitinated proteins in intestinal cells. We show for the first time that conserved AKIR-1 is important for the nuclear transport of proteasomes in a multicellular organism, suggesting a role for AKIR-1 in the maintenance of proteostasis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».