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Enregistrement W4301521645 · doi:10.26443/msurj.v12i1.42

CBS Domain: Its Structure, Ligand Binding, and Emerging Role in Regulation

2017· article· en· W4301521645 sur OpenAlexaff
David A. Scarlata

Notice bibliographique

RevueMcGill Science Undergraduate Research Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputational biologyLigand (biochemistry)CytosolProteomeFunction (biology)Nucleic acidTransmembrane proteinBiologyChemistryBiochemistryCell biologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Cystathionine β-synthase (CBS) domains are structurally conserved motifs that are present in the proteomes of species from all kingdoms of life. Signifying their importance are the hereditary diseases resulting from mutations within the CBS sequence. They are usually encoded in tandem within a plethora of non-functionally related cytosolic or transmembrane proteins, often intramolecularly dimerizing to afford what is known as a CBS pair or Bateman module. It is also known that these CBS pairs can further multimerize to form higher-order assemblies, which have functions that remain to be elucidated. Moreover, a wide range of adenosyl ligands, divalent cations and nucleic acids have been documented to bind CBS domains and induce conformational changes to the larger protein in which they reside, thus suggesting their involvement in protein regulation in response to intracellular energy status. Methods: This review was written based on the existing data currently available in the literature and included findings from 44 papers. Selection of papers was based on those that provided up-to-date information on the structural characteristics of CBS domains and their involvement in protein regulation. Summary: This review aims to conceptualize the architectural characteristics of CBS domains, the structural basis of ligand binding, and its involvement in the regulation of protein function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,341 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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