The Fc receptor supramolecular complex from RAW macrophages
Notice bibliographique
Résumé
The Fc receptor is expressed on the surface of RAW macrophages that can engulf IgG opsonized particles by phagocytosis. Isolation and characterization of these receptors and the identification of proteins involved is challenging. Live-cell Affinity Receptor Chromatography (LARC) (Janowski 2008) resulted in the identification of 336 proteins which are found to be specifically associated with the activated Fc receptor in RAW 264.7 macrophage cells. The proteins isolated were analyzed for protein-protein interactions using various analytical techniques including data mining through the use of iHOP, protein interaction databases such as Cytoscape, Osprey and STRING and literature searches, in order to create a signalling interaction pathway involving the proteins that are activated and associated with the Fcy receptor during receptor-mediated phagocytosis. The phospholipase C family of proteins have been previously identified as important in phagocytosis, and were identified by LARC. The selected isoforms were confirmed in RAW 264.7 cells via Western Blots, antibody staining, and live-cell confocal microscopy with fluorescently linked fusion proteins to verify the localization of the phospholipases, specifically PLC-β₃, PLC-β₄, PLC-y₁, PLC-d₁, PLC-ε₁ and PLC like -2 to the activated receptor complex.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».