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Enregistrement W4303856870 · doi:10.3390/microorganisms10101963

Interactions between Medications and the Gut Microbiome in Inflammatory Bowel Disease

2022· article· en· W4303856870 sur OpenAlexaffabout
Julia Eckenberger, James C. Butler, Çharles N. Bernstein, Fergus Shanahan, Marcus J. Claesson

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesScience Foundation Ireland
Mots-clésMicrobiomeInflammatory bowel diseaseUlcerative colitisDiseaseGut floraMedicineConfoundingMetagenomicsBiologyInternal medicineImmunologyBioinformaticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In view of the increasing evidence that commonly prescribed, non-antibiotic drugs interact with the gut microbiome, we re-examined the microbiota variance in inflammatory bowel disease (IBD) to determine the degree to which medication and supplement intake might account for compositional differences between disease subtypes and geographic location. We assessed the confounding effects of various treatments on the faecal microbiota composition (16S rRNA gene sequencing) in persons with Crohn's disease (CD; n = 188) or ulcerative colitis (UC; n = 161) from either Cork (Ireland) or Manitoba (Canada) sampled at three time points. The medication profiles between persons with UC and CD and from different countries varied in number and type of drugs taken. Among Canadian participants with CD, surgical resection and overall medication and supplement usage is significantly more common than for their Irish counterparts. Treatments explained more microbiota variance (3.5%) than all other factors combined (2.4%) and 40 of the 78 tested medications and supplements showed significant associations with at least one taxon in the gut microbiota. However, while treatments accounted for a relatively small proportion of the geographic contribution to microbiome variance between Irish and Canadian participants, additive effects from multiple medications contributed significantly to microbiome differences between UC and CD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,944
Score d'incertitude au seuil0,343

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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