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Enregistrement W4304775706 · doi:10.1111/pbr.13057

Genetic dissection of quantitative trait loci for spikelets compactness in two Yanzhan1‐derived recombinant inbred line wheat populations

2022· article· en· W4304775706 sur OpenAlexaff
Wenjing Hu, Hongya Wu, Chengbin Lu, Xu Zheng, Jizeng Jia, Weigang Xu

Notice bibliographique

RevuePlant Breeding · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésQuantitative trait locusBiologyInbred strainAllelePopulationGeneticsAgronomyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Spikelets compactness (SC) plays an important role in the yield improvement and Fusarium head blight (FHB) resistance of wheat. In this study, 151 recombinant inbred lines (RIL) derived from a cross between Yangmai 4 (YM4) and Yanzhan 1 (YZ1) and 143 RIL derived from a cross between Yangmai 5 (YM5) and YZ1 were used to construct two wheat hexaploidy genetic linkage maps, evaluate SC across three years and identify quantitative trait loci (QTL) for SC. A total of seven QTL were identified in two populations and explained the phenotypic variation ranging from 6.27% to 22.49%. Four QTL were co‐located in two genomic regions on chromosomes 2D and 6B, namely, QSc‐2D and QSc‐6B , respectively. Comparison analysis showed that QSc‐6B is a novel QTL, whereas QSc‐2D was located in the interval of Rht8 . Significant additive effects of QSc‐2D and QSc‐6B on SC were observed in two RIL populations. Moreover, the positive alleles of these two QTL extremely significantly increased grain number per spike (GNS) but did not have a significantly negative effect on thousand‐grain weight (TGW), kernel length (KL) and kernel weight (KW). Whether in spray or point inoculation, QSc‐6B did not significantly influence FHB resistance in two populations. However, QSc‐2D significantly affected FHB resistance in spray inoculation in YM4/YZ1 population. A breeder‐friendly Kompetitive Allele‐Specific PCR (KASP) marker KASP_6B for QSc‐6B has been developed and verified in a set of 181 wheat cultivars/lines. Furthermore, we preliminary analysed the candidate genes within the physical interval of QSc‐6B by sequence similarity, spatial expression patterns and collinearity analysis. TraesCS6B03G1206900 , TraesCS6B03G1214800 and TraesCS6B03G1218300 show specific expression in spikelet. These results provide valuable information for map‐based cloning of QSc‐6B and a useful tool for wheat breeding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,949
Score d'incertitude au seuil0,196

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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