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Enregistrement W4306147538 · doi:10.1101/2022.10.13.512100

Concurrent temporal patterning of neural stem cells in the fly visual system

2022· preprint· en· W4306147538 sur OpenAlexafffund
Urfa Arain, Ishrat Maliha Islam, Priscilla Valentino, Ted Erclik

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensCollege of Family Physicians of CanadaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of TorontoPfizer
Mots-clésNeuroepithelial cellBiologyNeuroblastMedullaNeuroscienceNeural stem cellAnatomyCell biologyStem cellNeurogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The temporal and spatial patterning of neural stem cells is a powerful mechanism by which to generate neural diversity in both vertebrate and invertebrate brains. In the Drosophila optic lobe, the neuroblasts (NBs) that generate the ∼120 neuronal cell types of the medulla are patterned by independent temporal and spatial inputs. In the temporal axis, a cascade of twelve transcription factors (TFs) are expressed in medulla NBs as they age. In the spatial axis, the neuroepithelium from which these NBs are generated is sub-divided into eight compartments by the expression of five additional TFs. Distinct neuronal types are generated by NBs based on their spatio-temporal address. Here, we describe a third major patterning axis that further diversifies neuronal fates in the medulla. We show that the symmetrically dividing neuroepithelial cells from which the medulla NBs are generated are temporally patterned by opposing gradients of the Imp and Syp RNA-binding proteins. Imp and Syp regulate the expression of a set of TFs in the neuroepithelium to confer NBs from the same spatio-temporal address with unique identities based on the developmental stage they are generated. We show that Imp and Syp differentially pattern NBs in the Vsx1-Hth spatio-temporal birth window to generate seven distinct neuronal cell types (Li2, TmY17, TmY15, Tm23, Pm3a, Pm3b and TmY12) in successive developmental windows. We further demonstrate that the birthdate of these neurons correlates with their final position in the adult cortex, resulting in unanticipated specializations of the retinotopic circuit in the anterior-posterior axis of the visual system. The concurrent temporal patterning of symmetrically and asymmetrically dividing neural stem cells thus acts as a powerful mechanism to couple the generation of neural diversity with circuit patterning.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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