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Enregistrement W4306359299 · doi:10.56588/iabcd.v1i2.66

IN SILICO SCREENING OF MAJOR CANCER DRUG TARGETS (GROWTH FACTOR RECEPTORS) FOR NATURE DERIVED PHYTOCHEMICALS

2022· article· en· W4306359299 sur OpenAlexaff
Tithi Trivedi, Siva Kumar, Archana Mankad, Saumya Patel, Rakesh Rawal, Himanshu Pandya

Notice bibliographique

RevueInternational Association of Biologicals and Computational Digest · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Treatment and Pharmacology
Établissements canadiensImpact
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDrug targetIn silicoReceptorBiologyChemistryPharmacologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cancer i s a group of abn ormal cells. The unregulated gro wth factor recepto r t yrosin e kinase ( GFR- TK) proteins are implicated in the proliferation o f mo re than 60 % o f all can cer t ypes. Screenin g o f ph ytoch emicals for their anti - angiogenic potential has b een a gro wing area o f research in the mod ern d ecad e. There i s a well - kno wn principle that natural co mpounds are active against several diseases, includin g variou s t yp es of can cer. Th e present research work fo cuses on kno wn gro wth factor receptors ( GFRs) as an important target fo r co mputation al s tudies. In this stud y, 96 curated anti - can cer co mpounds were virtu ally screened against the EGFR, FGFR, IGFR, and HGFR usin g molecular dockin g so ftware. For each GFR, we h ave considered ten top most results as potential hits. Among them, co mmon f i ve results are: Spiro solan e, Ginkgetin, Fangchinoline, Theaflavin and Ursolic acid. These co mpounds have b een reported to show antican cer activities in the l i t erature. With the help of different interaction analysis tools, the protein - l i gand inter action patterns between th e functional groups o f these co mpounds were analyzed. Hydro gen bonding and h ydrophobic forces are th e main co mponents o f th e interactions o f th ese hits, similar to those exp erimental fo r th e kno wn inhibitors. Fro m the maximu m nu mb ers o f hits, i t could be indicated that co mpounds Spirosolan e, Ginkgetin, Fan gchinoline, Th eaflavin and Ursolic acid are pro miscuous l ead s in the drug disco very process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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