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Enregistrement W4306404467 · doi:10.1038/s41598-022-21342-w

Discovery of small molecule inhibitors that effectively disrupt IQGAP1-Cdc42 interaction in breast cancer cells

2022· article· en· W4306404467 sur OpenAlexaff
Samar Sayedyahossein, Jessica M. Smith, Elena Barnaeva, Zhigang Li, Jun Choe, Michael Ronzetti, Christopher Dextras, Xin Hu, Juan Marugán, Noel Southall, Bolormaa Baljinnyam, Louise Thines, Andy D. Tran, Marc Ferrer, David B. Sacks

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésCDC42IQGAP1FilopodiaChemistryCancer cellCell biologySmall moleculeCell migrationRAC1Small GTPaseCancer researchBiologyBiochemistryGTPaseCancerCellCytoskeletonSignal transductionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The small GTPase Cdc42 is an integral component of the cytoskeleton, and its dysregulation leads to pathophysiological conditions, such as cancer. Binding of Cdc42 to the scaffold protein IQGAP1 stabilizes Cdc42 in its active form. The interaction between Cdc42 and IQGAP1 enhances migration and invasion of cancer cells. Disrupting this association could impair neoplastic progression and metastasis; however, no effective means to achieve this has been described. Here, we screened 78,500 compounds using a homogeneous time resolved fluorescence-based assay to identify small molecules that disrupt the binding of Cdc42 to IQGAP1. From the combined results of the validation assay and counter-screens, we selected 44 potent compounds for cell-based experiments. Immunoprecipitation and cell viability analysis rendered four lead compounds, namely NCGC00131308, NCGC00098561, MLS000332963 and NCGC00138812, three of which inhibited proliferation and migration of breast carcinoma cells. Microscale thermophoresis revealed that two compounds bind directly to Cdc42. One compound reduced the amount of active Cdc42 in cells and effectively impaired filopodia formation. Docking analysis provided plausible models of the compounds binding to the hydrophobic pocket adjacent to the GTP binding site of Cdc42. In conclusion, we identified small molecules that inhibit binding between Cdc42 and IQGAP1, which could potentially yield chemotherapeutic agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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