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Enregistrement W4306409445 · doi:10.1096/fj.202201263r

Early‐immediate gene Egr1 is associated with <scp>TGFβ1</scp> regulation of epigenetic reader Bromodomain‐containing protein 4 via the canonical Smad3 signaling in hepatic stellate cells in vitro and in vivo

2022· article· en· W4306409445 sur OpenAlexaff
Haimeng Tian, Feifan Xu, Feifei Zhao, Nachuan Pan, Sidan Lu, Xin Jia, Yajun Zhou

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver physiology and pathology
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésGene knockdownBromodomainHepatic stellate cellEGR1EpigeneticsBRD4Cancer researchBiologyTransforming growth factorDownregulation and upregulationJUNBCell biologySignal transductionThioacetamideGene expressionApoptosisGeneEndocrinologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Upon chronic damage to the liver, multiple cytokines stimulate hepatic stellate cells (HSCs), causing the alterations of gene expression profiles and thus leading to HSC activation, a key step in liver fibrogenesis. Activated HSCs are the dominant contributors to liver fibrosis. Bromodomain containing protein 4 (BrD4), an important epigenetic reader, was demonstrated to concentrate on hundreds of enhancers associated with genes involved in multiple profibrotic pathways, thereby directing HSC activation and the fibrotic responses. The present studies were designed to examine the effect of transforming growth factor beta‐1 (TGFβ1), the most potent pro‐fibrotic cytokine, on BrD4 expression in HSCs and, if so, elucidated the underlying mechanisms in vitro and in vivo. The experiments employed the heterogeneous TGFβ1 knockout (TGFβ1 +/− ) mice, gene knockdown in vivo, and a model of thioacetamide (TAA)‐induced liver injury. The results revealed that TGFβ1 enhanced BrD4 expression in HSCs, which was mediated, at least, by Smad3 signaling and early‐immediate gene Egr1 (early growth response‐1). TGFβ1‐induced Smad3 signaling increased Egr1 expression and promoted Egr1 binding to BrD4 promoter at a site around −111 bp, promoting BrD4 expression. Egr1 knockdown reduced BrD4 expression in HSCs in a mouse model of TAA‐induced liver injury and lessened liver fibrosis. Double fluorescence staining demonstrated a strong increase in BrD4 expression in activated HSCs in fibrotic areas of the human livers, paralleling the upregulation of p‐Smad3 and Egr1. This research suggested novel molecular events underlying the roles of the master pro‐fibrotic cytokine TGFβ1 in HSC activation and liver fibrogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,275
Score d'incertitude au seuil0,443

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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