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Enregistrement W4306663866 · doi:10.1002/alz.12800

Metabolomic and lipidomic signatures in autosomal dominant and late‐onset Alzheimer's disease brains

2022· article· en· W4306663866 sur OpenAlexfundno aff
Brenna C. Novotny, María Victoria Fernández, Ciyang Wang, John Budde, Kristy Bergmann, Abdallah M. Eteleeb, Joseph Bradley, Carol Webster, Curtis Ebl, Joanne Norton, Jen Gentsch, Umber Dube, Fengxian Wang, John C. Morris, Randall J. Bateman, Richard J. Perrin, Eric McDade, Chengjie Xiong, Jasmeer P. Chhatwal, Alison Goate, Martin R. Farlow, Peter R. Schofield, Helena C. Chui, Celeste M. Karch, Carlos Cruchaga, Bruno A. Benítez, Oscar Harari

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health ResearchAvid RadiopharmaceuticalsGenentechNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiDenali TherapeuticsGHR FoundationNorthern California Institute for Research and EducationPfizerBiogenBioClinicaHope Center for Neurological DisordersUniversity of Southern CaliforniaAstraZenecaU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeCure Alzheimer's FundMeso Scale DiagnosticsSanofiFONDATION ALZHEIMERAlzheimer's AssociationNovartis Pharmaceuticals CorporationAmgen
Mots-clésPSEN1TREM2MetabolomeMetabolomicsDiseaseBiologyGeneticsNeurodegenerationMetaboliteAlzheimer's diseaseBioinformaticsMedicinePresenilinInternal medicineEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: The identification of multiple genetic risk factors for Alzheimer's disease (AD) suggests that many pathways contribute to AD onset and progression. However, the metabolomic and lipidomic profiles in carriers of distinct genetic risk factors are not fully understood. The metabolome can provide a direct image of dysregulated pathways in the brain. METHODS: We interrogated metabolomic signatures in the AD brain, including carriers of pathogenic variants in APP, PSEN1, and PSEN2 (autosomal dominant AD; ADAD), APOE ɛ4, and TREM2 risk variant carriers, and sporadic AD (sAD). RESULTS: We identified 133 unique and shared metabolites associated with ADAD, TREM2, and sAD. We identified a signature of 16 metabolites significantly altered between groups and associated with AD duration. DISCUSSION: AD genetic variants show distinct metabolic perturbations. Investigation of these metabolites may provide greater insight into the etiology of AD and its impact on clinical presentation. HIGHLIGHTS: APP/PSEN1/PSEN2 and TREM2 variant carriers show distinct metabolic changes. A total of 133 metabolites were differentially abundant in AD genetic groups. β-citrylglutamate is differentially abundant in autosomal dominant, TREM2, and sporadic AD. A 16-metabolite profile shows differences between Alzheimer's disease (AD) genetic groups. The identified metabolic profile is associated with duration of disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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