Structural biology of <scp>DOCK‐family</scp> guanine nucleotide exchange factors
Notice bibliographique
Résumé
DOCK proteins are a family of multi‐domain guanine nucleotide exchange factors (GEFs) that activate the RHO GTPases CDC42 and RAC1, thereby regulating several RHO GTPase‐dependent cellular processes. DOCK proteins are characterized by the catalytic DHR2 domain (DOCK DHR2 ), and a phosphatidylinositol(3,4,5)P 3 ‐binding DHR1 domain (DOCK DHR1 ) that targets DOCK proteins to plasma membranes. DOCK‐family GEFs are divided into four subfamilies (A to D) differing in their specificities for CDC42 and RAC1, and the composition of accessory signalling domains. Additionally, the DOCK‐A and DOCK‐B subfamilies are constitutively associated with ELMO proteins that auto‐inhibit DOCK GEF activity. We review structural studies that have provided mechanistic insights into DOCK‐protein functions. These studies revealed how a conserved nucleotide sensor in DOCK DHR2 catalyses nucleotide exchange, the basis for how different DOCK proteins activate specifically CDC42 and RAC1, and sometimes both, and how up‐stream regulators relieve the ELMO‐mediated auto‐inhibition. We conclude by presenting a model for full‐length DOCK9 of the DOCK‐D subfamily. The involvement of DOCK GEFs in a range of diseases highlights the importance of gaining structural insights into these proteins to better understand and specifically target them.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».