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Enregistrement W4307069447 · doi:10.1002/em.22514

Impact of sampling time on the detection of mutations in rapidly proliferating tissues using transgenic rodent gene mutation models: A review

2022· review· en· W4307069447 sur OpenAlexafffund
George R. Douglas, Carol Beevers, B. Bhaskar Gollapudi, Zena Keig‐Shevlin, David Kirkland, Jason M. O’Brien, Jan van Benthem, Carole L. Yauk, Robert R. Young, Francesco Marchetti

Notice bibliographique

RevueEnvironmental and Molecular Mutagenesis · 2022
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensEnvironment and Climate Change CanadaUniversity of OttawaHealth Canada
Organismes subventionnairesHealth CanadaU.S. Food and Drug AdministrationEnvironment and Climate Change Canada
Mots-clésSomatic cellBiologyTransgeneMutationGeneGerm cellGermline mutationConcordanceAndrologyGeneticsBioinformaticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The OECD Test Guideline 488 (TG 488) for the Transgenic Rodent Gene Mutation Assay has undergone several revisions to update the recommended design for studying mutations in somatic tissues and male germ cells. The recently revised TG recommends a single sampling time of 28 days following 28 days of exposure (i.e., 28 + 28 days) for all tissues, irrespective of proliferation rates. An alternative design (i.e., 28 + 3 days) is appropriate when germ cell data is not required, nor considered. While the 28 + 28 days design is clearly preferable for slowly proliferating somatic tissues and germ cells, there is still uncertainty about the impact of extending the sampling time to 28 days for rapidly somatic tissues. Here, we searched the available literature for evidence supporting the applicability and utility of the 28 + 28 days design for rapidly proliferating tissues. A total of 79 tests were identified. When directly comparing results from both designs in the same study, there was no evidence that the 28 + 28 days regimen resulted in a qualitatively different outcome from the 28 + 3 days design. Studies with a diverse range of agents that employed only a 28 + 28 days protocol provide further evidence that this design is appropriate for rapidly proliferating tissues. Benchmark dose analyses demonstrate high quantitative concordance between the 28 + 3 and 28 + 28 days designs for rapidly proliferating tissues. Accordingly, our review confirms that the 28 + 28 days design is appropriate to assess mutagenicity in both slowly and rapidly proliferating somatic tissues, and germ cells, and provides further support for the recommended design in the recently adopted TG 488.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,192
Score d'incertitude au seuil0,936

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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