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Enregistrement W4307352645 · doi:10.1101/2022.10.26.513834

The protist ubiquitin ligase effector PbE3-2 targets RD21A to impede plant immunity

2022· preprint· en· W4307352645 sur OpenAlexfundno aff
Chao Li, Shaofeng Luo, Lu Feng, Qianqian Wang, Jiāsēn Chéng, Jiǎtāo Xiè, Yang Lin, Yànpíng Fù, Dàohóng Jiāng, Tao Chen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesState Key Laboratory of Agricultural MicrobiologyChinese Academy of SciencesInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of ChinaFundamental Research Funds for the Central UniversitiesHuazhong Agricultural UniversityStrong
Mots-clésClubrootBiologyEffectorPlant ImmunityPathogenUbiquitin ligaseArabidopsis thalianaFlagellinUbiquitinImmune systemMicrobiologyImmunityCell biologyArabidopsisBrassicaMutantGeneticsGeneBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Clubroot caused by the soil-borne protist pathogen Plasmodiophora brassicae is one of the most devastating diseases of Brassica oil and vegetable crops worldwide. Understanding the pathogen infection strategy is crucial for the development of disease control. However, the molecular mechanism by which this pathogen promotes infection remains largely unknown. Here, we identified a P. brassicae -secreted effector PbE3-2 that impedes plant immunity by ubiquitinating the immune regulator RD21A for degradation. Overexpression of PbE3-2 in Arabidopsis thaliana resulted in higher susceptibility to P. brassicae and decreases in chitin-triggered reactive oxygen species burst and expression of marker genes in salicylic acid signaling. PbE3-2 interacted with and ubiquitinated RD21A in vitro and in vivo . Mutant plants deficient in RD21A exhibited similar susceptibility and compromsied immune responses as in PbE3-2 overexpression plants. These results suggest that P. brassicae promotes clubroot disease through RD21A degradation mediated by the effector PbE3-2. As PbE3-2 is widely conserved across different P. brassicae pathotypes, the degradation of RD21A by PbE3-2 might be a prevalent infection strategy in this pathogen.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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