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Enregistrement W4307561750 · doi:10.1139/cjps-2022-0102

Diversity in genetic and downy mildew resistance among wild and mutagenized hops as revealed by single nucleotide polymorphisms and disease rating

2022· article· en· W4307561750 sur OpenAlexafffundvenueabout
Mohsin Abbas Zaidi, Ashok Somalraju, Kaushik Ghose, Jason McCallum, Aaron Mills, Sherry Fillmore, Bourlaye Fofana

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePowdery Mildew Fungal Diseases
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésDowny mildewBiologyGenetic diversityGeneticsSingle-nucleotide polymorphismPlant disease resistanceAlleleAmpliconGenotypeGeneHorticulturePolymerase chain reactionMedicinePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Studies on wild and landrace hops from the Canadian Maritimes are scarce. This study was undertaken to broaden the genetic base of hops and to assess the reaction of the generated variants to downy mildew (DM) disease. A landrace hop (PE Royalty (P-RL)) and a commercial cultivar (Alpharoma) were mutagenized using ethylmethane sulphonate (EMS), and single nucleotide polymorphism (SNP) variations were determined using an amplicon sequencing genetic diversity study. A subset of wild types and a subset of mutagenized hops were inoculated with DM spores and rated for disease symptoms in a controlled environment. The data showed large EMS-induced genetic diversity in the target genes along with natural variations in the wild types. A diversity in DM resistance within the studied collection was also observed. The study showed DM tolerance in some P-RL landrace seedlings, suggesting that these P-RL landraces must have acquired and developed adaptation mechanisms to co-evolve with DM disease in the environment. Further, EMS-induced mutagenesis increased allelic variations that contributed to increased DM resistance in some seedlings. The data recommend the use of true hop seeds for increased genetic variability in breeding programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,083
Score d'incertitude au seuil0,164

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,173
Écart entre enseignants0,161 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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