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Enregistrement W4307570293 · doi:10.1016/j.jcmgh.2022.10.014

The Pregnane X Receptor and Indole-3-Propionic Acid Shape the Intestinal Mesenchyme to Restrain Inflammation and Fibrosis

2022· article· en· W4307570293 sur OpenAlexafffund
Kyle L. Flannigan, Kristoff Nieves, Holly Szczepanski, Alex Serra, Joshua W. Lee, Laurie Alston, Hena R. Ramay, Sridhar Mani, Simon A. Hirota

Notice bibliographique

RevueCellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCrohn's and Colitis CanadaSociety of Architectural HistoriansCanada Research ChairsU.S. Department of Defense
Mots-clésInflammationFibrosisPregnane X receptorColitisBiologyInnate immune systemInflammatory bowel diseaseImmunologyImmune systemMedicineInternal medicineNuclear receptorBiochemistryTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background & Aims Fibrosis is a common complication of inflammatory bowel diseases (IBDs). The pregnane X receptor (PXR) (encoded by NR1I2 ) suppresses intestinal inflammation and has been shown to influence liver fibrosis. In the intestine, PXR signaling is influenced by microbiota-derived indole-3-propionic acid (IPA). Here, we sought to assess the role of the PXR in regulating intestinal inflammation and fibrosis. Methods Intestinal inflammation was induced using dextran sulfate sodium (DSS). Fibrosis was assessed in wild-type (WT), Nr1i2 -/- , epithelial-specific Nr1i2 -/- , and fibroblast-specific Nr1i2 -/- mice. Immune cell influx was quantified by flow cytometry and cytokines by Luminex. Myofibroblasts isolated from WT and Nr1i2 -/- mice were stimulated with cytomix or lipopolysaccharide, and mediator production was assessed by quantitative polymerase chain reaction and Luminex. Results After recovery from DSS-induced colitis, WT mice exhibited fibrosis, a response that was exacerbated in Nr1i2 -/- mice. This was correlated with greater neutrophil infiltration and innate cytokine production. Deletion of the PXR in fibroblasts, but not the epithelium, recapitulated this phenotype. Inflammation and fibrosis were reduced by IPA administration, whereas depletion of the microbiota exaggerated intestinal fibrosis. Nr1i2 -deficient myofibroblasts were hyperresponsive to stimulation, producing increased levels of inflammatory mediators compared with WT cells. In biopsies from patients with active Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), expression of NR1I2 was reduced, correlating with increased expression of fibrotic and innate immune genes. Finally, both CD and UC patients exhibited reduced levels of fecal IPA. Conclusions These data highlight a role for IPA and its interactions with the PXR in regulating the mesenchyme and the development of inflammation and fibrosis, suggesting microbiota metabolites may be a vital determinant in the progression of fibrotic complications in IBD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations87
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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