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Enregistrement W4307947157 · doi:10.3390/cells11213423

From Differential DNA Methylation in COPD to Mitochondria: Regulation of AHRR Expression Affects Airway Epithelial Response to Cigarette Smoke

2022· article· en· W4307947157 sur OpenAlexaff
Qing Chen, Kingsley Okechukwu Nwozor, Maarten van den Berge, Dirk‐Jan Slebos, Alen Faiz, Marnix R. Jonker, H. Marike Boezen, Irene H. Heijink, Maaike de Vries

Notice bibliographique

RevueCells · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiquePediatric health and respiratory diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesLung Foundation NetherlandsUniversitair Medisch Centrum GroningenChina Scholarship Council
Mots-clésDNA methylationCOPDApoptosisOxidative stressChemistryDNA damageNecroptosisMitochondrionMethylationCancer researchImmunologyMolecular biologyBiologyGene expressionMedicineProgrammed cell deathDNABiochemistryInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cigarette smoking causes hypomethylation of the gene Aryl Hydrocarbon Receptor Repressor (AHRR), which regulates detoxification and oxidative stress-responses. We investigated whether AHRR DNA methylation is related to chronic obstructive pulmonary disease (COPD) and studied its function in airway epithelial cells (AECs). The association with COPD was assessed in blood from never and current smokers with/without COPD, and in AECs from ex-smoking non-COPD controls and GOLD stage II-IV COPD patients cultured with/without cigarette smoke extract (CSE). The effect of CRISPR/Cas9-induced AHRR knockout on proliferation, CSE-induced mitochondrial membrane potential and apoptosis/necrosis in human bronchial epithelial 16HBE cells was studied. In blood, DNA methylation of AHRR at cg05575921 and cg21161138 was lower in smoking COPD subjects than smoking controls. In vitro, AHRR DNA methylation at these CpG-sites was lower in COPD-derived than control-derived AECs only upon CSE exposure. Upon AHRR knockout, we found a lower proliferation rate at baseline, stronger CSE-induced decrease in mitochondrial membrane potential, and higher CSE-induced late apoptosis/necroptosis. Together, our results show lower DNA methylation of AHRR upon smoking in COPD patients compared to non-COPD controls. Our data suggest that higher airway epithelial AHRR expression may lead to impaired cigarette smoke-induced mitochondrial dysfunction and apoptosis/necroptosis, potentially promoting unprogrammed/immunogenic cell death.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,664
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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