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Enregistrement W4308057531 · doi:10.1038/s41416-022-02014-y

Increased FOXJ1 protein expression is associated with improved overall survival in high-grade serous ovarian carcinoma: an Ovarian Tumor Tissue Analysis Consortium Study

2022· article· en· W4308057531 sur OpenAlexafffund
Ashley Weir, Eunyoung Kang, Nicola S. Meagher, Gregg Nelson, Prafull Ghatage, Cheng‐Han Lee, Marjorie J. Riggan, Aleksandra Gentry‐Maharaj, Andy Ryan, Naveena Singh, Martin Widschwendter, Jennifer Alsop, Michael S. Anglesio, Matthias W. Beckmann, Jessica Berger, Christiani Bisinotto, Jessica Boros, Alison H. Brand, James D. Brenton, Angela Brooks‐Wilson, Michael E. Carney, Julie M. Cunningham, Kara L. Cushing‐Haugen, Cezary Cybulski, Esther Elishaev, Ramona Erber, Sián Fereday, Anna Fischer, Luis Paz‐Ares, Javier Machín Gayarre, Blake C. Gilks, Marcel Grube, Paul R. Harnett, Holly R. Harris, Arndt Hartmann, Alexander Hein, Joy Hendley, Brenda Y. Hernandez, Sabine Heublein, Yajue Huang, Tomasz Huzarski, Anna Jakubowska, Mercedes Jimenez‐Liñan, Catherine J. Kennedy, F. Kommoss, Jennifer M. Koziak, Bernhard Kraemer, Nhu D. Le, Jaime Lesnock, Jenny Lester, Jan Lubiński, Janusz Menkiszak, Britta Ney, Alexander Olawaiye, Sandra Oršulić, Ana Osório, Luis A. Díaz‐Robles, Matthias Ruebner, Mitul Shah, Raghwa Sharma, Yurii B. Shvetsov, Helen Steed, Aline Talhouk, Sarah E. Taylor, Nadia Traficante, Robert A. Vierkant, Chen Wang, Lynne R. Wilkens, Stacey J. Winham, Javier Benı́tez, Andrew Berchuck, David D.L. Bowtell, Francisco José Cândido dos Reis, Linda S. Cook, Anna DeFazio, Jennifer A. Doherty, Peter A. Fasching, María J. García, Ellen L. Goode, Marc T. Goodman, Jacek Gronwald, David G. Huntsman, Beth Y. Karlan, Stefan Kommoss, Francesmary Modugno, Joellen M. Schildkraut, Hans‐Peter Sinn, Annette Staebler, Linda E. Kelemen, Caroline E. Ford, Usha Menon, Paul D.P. Pharoah, Martin Köbel, Susan J. Ramus

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Cancer · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFOXO transcription factor regulation
Établissements canadiensAlberta Health ServicesCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreVancouver General HospitalUniversity of British ColumbiaFoothills Medical CentreUniversity of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMedical Research and Materiel CommandNational Center for Advancing Translational SciencesEuropean Regional Development FundInstituto de Salud Carlos IIICancer Council TasmaniaNational Health and Medical Research CouncilHorizon 2020 Framework ProgrammeNational Institutes of HealthTranslational Cancer Research NetworkUniversity College LondonCancer Institute NSWNational Cancer InstitutePeter MacCallum FoundationNSW Ministry of HealthAmerican Cancer SocietyCancer Council South AustraliaPomorski Uniwersytet Medyczny W SzczecinieOvarian Cancer Research FundMinisterio de Economía y CompetitividadCancer Council VictoriaUniversity of PittsburghUniversity of New South WalesCancer Council NSWUniversität HeidelbergCanadian Institutes of Health ResearchMedical Research CouncilDepartment of Health and Social CareNational Institute for Health and Care ResearchMichael Smith Health Research BCCanada Research ChairsNIHR Cambridge Biomedical Research CentreUniversity of CambridgeFred C. and Katherine B. Andersen FoundationCancer AustraliaOvarian Cancer ActionCalgary Laboratory ServicesMayo Foundation for Medical Education and ResearchDeutsche ForschungsgemeinschaftVGH and UBC Hospital FoundationU.S. Department of DefenseCancer Research UKMinnesota Ovarian Cancer AllianceNational Center for Research ResourcesBC Cancer FoundationOak FoundationOvarian Cancer AustraliaConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCancer Research SocietyEuropean Commission
Mots-clésImmunohistochemistrySerous carcinomaSerous fluidTissue microarrayOvarian carcinomaOvarian cancerOncologyUnivariate analysisSurvival analysisMedicinePathologyBiologyMultivariate analysisInternal medicineCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Recently, we showed a >60% difference in 5-year survival for patients with tubo-ovarian high-grade serous carcinoma (HGSC) when stratified by a 101-gene mRNA expression prognostic signature. Given the varied patient outcomes, this study aimed to translate prognostic mRNA markers into protein expression assays by immunohistochemistry and validate their survival association in HGSC. METHODS: Two prognostic genes, FOXJ1 and GMNN, were selected based on high-quality antibodies, correlation with protein expression and variation in immunohistochemical scores in a preliminary cohort (n = 134 and n = 80, respectively). Six thousand four hundred and thirty-four (FOXJ1) and 5470 (GMNN) formalin-fixed, paraffin-embedded ovarian neoplasms (4634 and 4185 HGSC, respectively) represented on tissue microarrays from the Ovarian Tumor Tissue Analysis consortium underwent immunohistochemical staining and scoring, then univariate and multivariate survival analysis. RESULTS: Consistent with mRNA, FOXJ1 protein expression exhibited a linear, increasing association with improved overall survival in HGSC patients. Women with >50% expression had the most favourable outcomes (HR = 0.78, 95% CI 0.67-0.91, p < 0.0001). GMNN protein expression was not significantly associated with overall HSGC patient survival. However, HGSCs with >35% GMNN expression showed a trend for better outcomes, though this was not significant. CONCLUSION: We provide foundational evidence for the prognostic value of FOXJ1 in HGSC, validating the prior mRNA-based prognostic association by immunohistochemistry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,709
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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