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Enregistrement W4308544300 · doi:10.1016/j.ygyno.2022.10.022

Profiling the immune landscape in mucinous ovarian carcinoma

2022· article· en· W4308544300 sur OpenAlexafffund
Nicola S. Meagher, Phineas T. Hamilton, Katy Milne, Shelby Thornton, Bronwyn Harris, Ashley Weir, Jennifer Alsop, Christiani Bisinoto, James D. Brenton, Angela Brooks‐Wilson, Derek S. Chiu, Kara L. Cushing‐Haugen, Sián Fereday, Dale W. Garsed, Simon A. Gayther, Aleksandra Gentry‐Maharaj, C. Blake Gilks, Mercedes Jimenez‐Liñan, Catherine J. Kennedy, Nhu D. Le, Anna Piskorz, Marjorie J. Riggan, Mitul Shah, Naveena Singh, Aline Talhouk, Martin Widschwendter, David D.L. Bowtell, Francisco José Cândido dos Reis, Linda S. Cook, Renée T. Fortner, María J. García, Holly R. Harris, David G. Huntsman, Anthony N. Karnezis, Martin Köbel, Usha Menon, Paul D.P. Pharoah, Jennifer A. Doherty, Michael S. Anglesio, Malcolm C. Pike, Celeste Leigh Pearce, Michael Friedländer, Anna DeFazio, Brad H. Nelson, Susan J. Ramus

Notice bibliographique

RevueGynecologic Oncology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of British ColumbiaVancouver General HospitalCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreFoothills Medical CentreBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCancer Council TasmaniaNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilHorizon 2020 Framework ProgrammeOak FoundationBC Cancer FoundationCanada Research ChairsCancer Research SocietyConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCancer Council VictoriaUniversity of New South WalesCanadian Institutes of Health ResearchCancer Institute NSWEuropean CommissionCalgary Laboratory ServicesUniversity of CambridgeUniversity College LondonCancer Research UKMichael Smith Health Research BCFaculty of Medicine and Health, University of SydneyTranslational Cancer Research NetworkEuropean Regional Development FundBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute for Health and Care ResearchCancer Council NSWOvarian Cancer AustraliaPeter MacCallum FoundationMedical Research and Materiel CommandNSW Ministry of HealthCancer Council South AustraliaDeutsches KrebsforschungszentrumOvarian Cancer Research FundCancer AustraliaNational Institutes of Health
Mots-clésCD20FOXP3CD68Stromal cellImmune systemCD8MedicineCancer researchTissue microarrayCD3Tumor microenvironmentPathologyImmunohistochemistryOncologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Mucinous ovarian carcinoma (MOC) is a rare histotype of ovarian cancer, with low response rates to standard chemotherapy, and very poor survival for patients diagnosed at advanced stage. There is a limited understanding of the MOC immune landscape, and consequently whether immune checkpoint inhibitors could be considered for a subset of patients. METHODS: We performed multicolor immunohistochemistry (IHC) and immunofluorescence (IF) on tissue microarrays in a cohort of 126 MOC patients. Cell densities were calculated in the epithelial and stromal components for tumor-associated macrophages (CD68+/PD-L1+, CD68+/PD-L1-), T cells (CD3+/CD8-, CD3+/CD8+), putative T-regulatory cells (Tregs, FOXP3+), B cells (CD20+/CD79A+), plasma cells (CD20-/CD79a+), and PD-L1+ and PD-1+ cells, and compared these values with clinical factors. Univariate and multivariable Cox Proportional Hazards assessed overall survival. Unsupervised k-means clustering identified patient subsets with common patterns of immune cell infiltration. RESULTS: Mean densities of PD1+ cells, PD-L1- macrophages, CD4+ and CD8+ T cells, and FOXP3+ Tregs were higher in the stroma compared to the epithelium. Tumors from advanced (Stage III/IV) MOC had greater epithelial infiltration of PD-L1- macrophages, and fewer PD-L1+ macrophages compared with Stage I/II cancers (p = 0.004 and p = 0.014 respectively). Patients with high epithelial density of FOXP3+ cells, CD8+/FOXP3+ cells, or PD-L1- macrophages, had poorer survival, and high epithelial CD79a + plasma cells conferred better survival, all upon univariate analysis only. Clustering showed that most MOC (86%) had an immune depleted (cold) phenotype, with only a small proportion (11/76,14%) considered immune inflamed (hot) based on T cell and PD-L1 infiltrates. CONCLUSION: In summary, MOCs are mostly immunogenically 'cold', suggesting they may have limited response to current immunotherapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,138
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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