TREM1 <sup>+</sup> regulatory myeloid cells expand in steatohepatitis-HCC and associate with poor prognosis and therapeutic resistance to immune checkpoint blockade
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Hepatocellular carcinoma (HCC) is an inflammation-associated cancer arising from viral and non-viral etiologies. Immune checkpoint blockade primarily benefits patients with viral HCC. Expansion of suppressive myeloid cells is a hallmark of chronic inflammation and cancer, but their heterogeneity in HCC is not fully resolved and might underlie immunotherapy resistance in the steatohepatitis setting. Here, we present a high resolution atlas of hepatic innate immune cells from patients with HCC that unravels a steatohepatitis contexture characterized by the emergence of high entropy myeloid cell states and myeloid-biased NK cell differentiation. We identify a discrete population of tumor-infiltrating myeloid cells, predominant in the steatohepatitis setting, that expresses a variety of myeloid lineage-affiliated genes, including granulocyte, macrophage and dendritic cell features, and can be identified in HCC tumors based on selective dual expression of TREM1 and CD163 . Functional characterization reveals that TREM1 + CD163 + myeloid cells highly express TGFβ and IL-13RA, localize to HCC fibrotic lesions, and potently suppress T cell effector functions ex vivo , a function further potentiated by TREM1 engagement. We refer to this population as TREM1 + CD163 + regulatory myeloid cells (TREM1 + CD163 + M reg ). Deconvolution analyses in large cohorts of patients with HCC and other solid tumors reveals that the density of TREM1 + CD163 + M reg increases in advanced stages, associates with poor prognosis, and therapeutic resistance to PD-1 blockade. Our data support myeloid subset-targeted immunotherapies to treat HCC and identify TREM1 as a therapeutic target. HIGHLIGHTS Atlas of hepatic innate immune cells (100,000 transcriptomes) from patients with HCC Core signatures to identify, discriminate and localize innate lymphoid and myeloid cells A population of TREM1 + CD163 + myeloid cells, referred to as TREM1 + CD163 + M reg , expands in steatohepatitis HCC TREM1 + CD163 + M reg express granulocyte- and macrophage/dendritic cell-lineage genes TREM1 + CD163 + M reg potently suppress T cell effector functions, which is potentiated by TREM1 engagement by cognate ligands TREM1 + CD163 + M reg produce high levels of TGFβ and populate fibrotic lesions The density of TREM1 + CD163 + M reg increases in advanced HCC and associate with poor patient survival The density of TREM1 + CD163 + M reg associates with resistance to immune checkpoint blockade in other solid tumors
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».