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Enregistrement W4308976535 · doi:10.1093/neuonc/noac209.183

CSIG-34. LIN28B-LET-7-PBK PATHWAY IS AN IMPORTANT REGULATOR OF GROUP 3 MEDULLOBLASTOMA PROLIFERATION

2022· article· en· W4308976535 sur OpenAlexaff
Shubin Shahab, Jessica Sun, Haritha Kunhiraman, Matthew Schneiderjan, Kyle Juraschka, Sachin Kumar, Michael D. Taylor, Tobey J. MacDonald, Anna Kenney

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene knockdownCell growthApoptosisSmall hairpin RNACancer researchDownregulation and upregulationMedulloblastomaMetastasisBiologyCell cycleStem cellCell biologyCancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Children with Group 3 medulloblastoma (MB) have a very poor long-term outcome and many do not survive beyond 5 years. Several drivers for Group 3 MB have been identified but none have resulted in targeted therapy to date. LIN28B is a stem cell factor upregulated in Group 3 MB and is associated with worse survival. Here we investigate the role of the LIN28B pathway in Group 3 MB development. Pharmacologic inhibition of the LIN28B pathway is feasible and may provide a unique opportunity to target this tumor. Using LIN28B knockdown and overexpression in Group 3 MB cells we test LIN28B’s effect on proliferation, self-renewal and metastasis. We investigate the effect of LIN28B knockdown on survival as well as proliferation and apoptosis markers using orthotopic xenografts in vivo. We also investigate the role of let-7 and its downstream target PBK on Group 3 MB proliferation. Finally, we use a LIN28 inhibitor 1632 and a PBK inhibitor HITOPK032 to treat Group 3 MB cell lines and then assess their impact on proliferation and apoptosis. We find that down-regulation of LIN28B or PBK using shRNA results in significant reduction in cell proliferation. In contrast overexpression of LIN28B increases Group 3 cell proliferation and tumor sphere formation. LIN28B knockdown also significantly (p< 0.01) increases survival in mice with orthotopic Group 3 tumors. The LIN28 inhibitor 1632 also leads to significant reduction in MB growth through decreased cell cycle entry and increased apoptosis. In addition, HITOPK032 also demonstrates significant reduction in Group 3 MB cell proliferation at low micromolar concentration. We also demonstrate that HITOPK032 in combination with CDK 4/6 inhibition can additively inhibit proliferation of Group 3 MB cells. Our study establishes a critical role for the LIN28B-let-7-PBK pathway in Group3 MB and provides encouraging preliminary preclinical results for drugs that target this pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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