MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4309016124 · doi:10.1093/neuonc/noac209.877

EXTH-79. HIJACKING A NEURODEVELOPMENTAL EPIGENOMIC PROGRAM IN METASTATIC DISSEMINATION OF MEDULLOBLASTOMA

2022· article· en· W4309016124 sur OpenAlexaff
Han Zou, Bradley Poore, Emily Brown, Patel Yash, Zhongliang Hu, Xuejun Li, Ian F. Pollack, Robert M. Friedlander, Sarah J. Hainer, Michael D. Taylor, Baoli Hu

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaCerebellumBiologyReelinEpigenomicsChromatinNeuroscienceTranscription factorDAB1EZH2Cancer researchGene expressionGeneticsGeneDNA methylationReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Normal brain development relies on precise genetic and epigenetic spatiotemporal regulation of gene expression. How dysregulation of neurodevelopment relates to medulloblastoma, the most common pediatric brain tumor, remains elusive. Here, we uncovered a novel neurodevelopmental epigenomic program that regulates Purkinje cell migration in developing cerebellum is hijacked to induce tumor metastatic dissemination in medulloblastoma. Integrating publicly available datasets with our in-house data, unsupervised analyses revealed that BAF60C/SMARCD3, a subunit of SWI/SNF chromatin remodeling complex, promotes tumor cell migration in vitro and metastasis in vivo. Based on analyzing the single-cell RNAseq data of cerebellum developmental trajectory in mice and humans, aligning with the medulloblastoma patients’ datasets, we found that BAF60C/SMARCD3 regulated DAB1-mediated Reelin signaling is involved in Purkinje cell positioning during cerebellum development and medulloblastoma metastasis by orchestrating the cis-regulatory elements (CREs) at the DAB1 gene locus. Moreover, analysis of spatiotemporal gene expression and chromatin architecture in the human and mouse cerebellum demonstrated that transcription activity of the BAF60C/SMARCD3-DAB1 circuit is downregulated in a mature state of cerebellar development, however, is upregulated in metastatic medulloblastoma. We further identified that a core set of transcription factors, enhancer of zeste homolog 2 (EZH2) and nuclear factor I X (NFIX), bi-directionally control BAF60C/SMARCD3 transcriptional regulation by coordinating with the CREs at the BAF60C/SMARCD3 gene locus to form a chromatin hub during developing cerebellar development and medulloblastoma metastatic dissemination. Highly expressed BAF60C/SMARCD3 activates the Reelin/DAB1 signaling pathway downstream Src kinase, which was validated in the pair-wised primary and metastatic tumors from medulloblastoma patients. Preclinical medulloblastoma mouse models revealed that inhibiting Src activity reduces tumor cell migration and metastatic dissemination at a lower and safe dose. Together, these data deepen our understanding of how the developmental program influences disease progression and provide an opportunity for the development of therapeutics for this devastating brain cancer in children.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,218
Score d'incertitude au seuil0,582

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeuro-OncologyMême sujetChromatin Remodeling and CancerTravaux en français237 207