Abstract B024: Phosphoinositide focused CRISPR screen reveals ITGAV as a critical gene in pancreatic cancer growth and invasion
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Pancreatic Cancer (PC) is one of the most aggressive cancer types, with less than 10% of patients surviving at 5-years. One hallmark of PC is the frequent mutation of the oncogene KRAS resulting in the constitutive activation of the phosphoinositide-3-kinase (PI3K) signaling pathway. The PI3K pathway is an intracellular signaling pathway that regulates cell growth, metabolism, and survival in response to extracellular signals. Given the importance of deregulated phosphoinositide (PI) signaling in PC, we hypothesize that genes coding for PI-metabolizing enzymes and effectors may have significant and unappreciated roles in PC. Methods: We generated a CRISPR knockout (KO) library that targets 1,534 PI-associated genes to discover novel essential genes in PC. Results: In a PANC-1 screen, we identified 106 essential genes across all timepoints, including 28 novel candidate genes and 78 previously identified essential genes. Among six validated candidate genes, we demonstrate that Integrin Subunit Alpha V (ITGAV) is a protein with clinical importance in PC. Treatment of PC cell lines with an ITGAV integrin antagonist as well as KO of ITGAV resulted in reduced cancer associated phenotypes in vitro, including reduced proliferation rate and compromised migration and invasion capacity. Ongoing studies will investigate perturbations in signaling pathways associated with ITGAV, and aim to elucidate roles for ITGAV in metastatic progression and therapy response. Conclusions: Overall, these findings indicate that ITGAV inhibition represents a putative strategy for the treatment of PC. Citation Format: Daniel K.C. Lee, Ryan Loke, Lydia To, Keyue Chen, Jonathan T.S. Chow, Leonardo Salmena. Phosphoinositide focused CRISPR screen reveals ITGAV as a critical gene in pancreatic cancer growth and invasion [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Pancreatic Cancer; 2022 Sep 13-16; Boston, MA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2022;82(22 Suppl):Abstract nr B024.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».