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Enregistrement W4309108410 · doi:10.1158/1538-7445.panca22-a077

Abstract A077: PancreaCult™ Organoid Medium Kits support the robust establishment and expansion of human pancreatic duct organoids

2022· article· en· W4309108410 sur OpenAlexaff
Nina Quiskamp, Angela Tsai, Joanna Pan, Misha Hasan, George J. Chang, Isabella T. Tai, Allen Eaves, Sharon A. Louis, Ryan Conder

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensTerry Fox Research InstituteCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreStemcell Technologies
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOrganoidMatrigelPancreatic ductCell biologyPDX1Cell cultureBiologyChemistryPancreasEndocrinologyIslet

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Organoid culture is a novel in vitro culture method that promotes the growth of primary and PSC-derived cells in three-dimensional culture to generate structures that recapitulate tissue morphology. We have developed PancreaCult™ Organoid Medium Kits (Human), which combine PancreaCult™ Organoid Initiation Medium (OIM) and serum-free PancreaCult™ Organoid Growth Medium (OGM) into a robust and standardized workflow for the establishment and expansion of pancreatic duct organoids. To establish organoids, fresh or cryopreserved islet-depleted exocrine tissue was seeded in Corning® Matrigel® domes and cultured in PancreaCult™ OIM. After 3 days, the medium was changed to PancreaCult™ OGM and the organoids were passaged and maintained in this medium thereafter, and passaged as fragments every 4 - 7 days. Organoids were successfully established from all 5 donors with a 2- to 6-fold expansion in cell numbers every 7 - 14 days. Real-time PCR and immunocytochemistry demonstrated that these organoids express pancreatic duct markers (PDX1, SOX9, KRT19, CFTR, CA2, and MUC1), as well as proliferation and stem cell markers, Ki-67 and LGR5, respectively. Pancreatic duct organoids could be maintained for at least 10 passages (n = 3) and cryopreserved as fragments that could be used for rapid re-establishment of cultures at later time points. Organoids could also be dissociated and re-seeded in Prostaglandin E2-free PancreaCult™ OGM supplemented with ROCK inhibitor, Y-27632 and 10% FBS on Transwell® inserts to create 2D monolayers. In addition to normal pancreatic duct cultures, PancreaCult™ OGM supported the efficient long-term expansion of 4 pre-established pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) organoid lines and maintained the mutational profile of the parent line after 5 passages, as determined through whole exome sequencing of 29 cancer-associated genes. Through the optional removal of epidermal growth factor (EGF), PancreaCult™ OGM can be modified to suppress normal cell growth to select for tumor cells with activating KRAS mutations. Our results demonstrate that PancreaCult™ Organoid Medium Kits provide a robust and flexible in vitro culture system for the establishment and expansion of normal pancreatic duct cells, as well as the long-term expansion of PDAC organoids. Citation Format: Nina Quiskamp, Angela Tsai, Joanna Pan, Misha Hasan, George Chang, Isabella T. Tai, Allen C. Eaves, Sharon A. Louis, Ryan K. Conder. PancreaCult™ Organoid Medium Kits support the robust establishment and expansion of human pancreatic duct organoids [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Pancreatic Cancer; 2022 Sep 13-16; Boston, MA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2022;82(22 Suppl):Abstract nr A077.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,365
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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