An RFX transcription factor regulated ciliogenesis in the progenitors of choanoflagellates and animals
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Little is known about the origins of the transcriptional modules that coordinate cell-type specific functions in animals. The controlled expression of one cellular feature – the cilium – was likely critical during early animal evolution. Two key transcription factors, RFX and FoxJ1, coordinate ciliogenesis in animals but are absent from the genomes of most other ciliated eukaryotes, raising the question of how the transcriptional regulation of ciliogenesis has evolved. To reconstruct the evolution of the RFX/FoxJ1 transcriptional module and its role in the regulation of ciliogenesis, we investigated RFX and FoxJ1 function in one of the closest living relatives of animals, the choanoflagellate Salpingoeca rosetta . Targeted disruption of the S. rosetta RFX homolog cRFXa resulted in delayed cell proliferation and aberrant ciliogenesis, marked by the collapse and resorption of nascent cilia. Ciliogenesis genes and foxJ1 were significantly down-regulated in cRFXa mutants, consistent with a pre-animal ancestry for this transcriptional module. We also found that cRFXa protein preferentially binds to a sequence motif that is enriched in the promoters of S. rosetta ciliary genes and matches the sequence motif bound by animal RFX proteins. These findings suggest that RFX coordinated ciliogenesis before the divergence of animals and choanoflagellates, and that the deployment of this module may have provided a mechanism to differentiate ciliated and non-ciliated cell types in early animal evolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».