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Enregistrement W4309191159 · doi:10.1158/1538-7445.panca22-c075

Abstract C075: The loss of ATRX induces a sex-specific progression of pancreatic ductal adenocarcinoma in the presence of oncogenic KRASG12D

2022· article· en· W4309191159 sur OpenAlexaff
Aswin Sureshkumar, Phyo Wei Win, Christopher L. Pin

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésATRXCancer researchPancreatic cancerBiologyCancerSynthetic lethalityPancreasPathologyMedicineDNA repairInternal medicineEndocrinologyMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is currently the third leading cause of cancer-related deaths primarily due to a lack of effective early screening and the tumor microenvironment increasing resistance to chemotherapy. Somatic mutation in oncogenic KRASG12D appears in 97% of PDAC patients, however, the addition of environmental and epigenetic stressors are required to promote PDAC initiation and progression from acinar cells. We are elucidating the mechanism by which a loss of α-thalassemia, mental-retardation, X-linked (ATRX), a SWI/SNF chromatin remodeling protein, potentiates acinar cells to develop neoplastic lesions in females. Young et al. have confirmed that female mice with a loss of Atrx, combined with KRASG12D, have shown increased acinar-to-duct cell metaplasia (ADM), increased fibrosis, inflammation, and pancreatic intraepithelial neoplasias (PanINs) lesions relative to mice expressing KRASG12D and Atrx. I hypothesize that a loss of ATRX function increases sensitivity to KRASG12D in PDAC by affecting DNA damage and repair pathways and altering gene expression in acinar cells in a sex-specific fashion. Methods: Mice with an acinar-specific Atrx deletion and oncogenic KRASG12D expression were generated by mating to mice targeting an inducible creERT to the Ptf11α gene (PtflacreERT). Mice were gavaged with tamoxifen and pancreatic injury was induced in these mice (Ptf11αcreERT KRASLSLG12DAtrxfl/fl) with cerulein 10 days later. Mice are monitored for two and five weeks following cerulein treatment and pancreatic tissue was collected for molecular, biochemical, and histological analysis. In addition, pre-neoplastic pancreatic organoid cultures +/- ATRX expression were generated to assess differences in growth rates and chemotherapy resistance. Results: Preliminary results have shown increased sensitivity to chronic pancreatitis is predicted to be observed specifically in KRASG12D Atrx-/- female pancreatic tissue and derived organoids. Conversely, a protective effect stimulated by a loss of ATRX is observed in KRASG12D Atrx-/- male mice, indicated by less ADM/PanIN lesions and greater acinar cells. Discussion: A healthier prognosis in Atrx-/-, KRAS activated male mice suggests that the interaction between ATRX and various scaffold proteins (PRC2, DAXX, EZH2, etc.) alters chromosomal architecture, possibly altering gene expression via X chromosome inactivation or reactivation. Sex-specific differences in pancreatic tissue phenotype of Atrx-/- mice are predicted to arise from differential effects of ATRX in triggering acinar cell genomic instability in female mice to prevent the resolution of dsDNA breaks via non-homologous end joining to sensitize acinar cells to oncogenic KRAS. Future experiments will focus on establishing pre-neoplastic organoid lines derived from inflamed murine pancreata to elucidate the signalling pathway of ATRX that likely stimulates a differential gene and protein expression involved in a better prognosis in KRASG12D activated, Atrx-/- male mice. Citation Format: Aswin Sureshkumar, Phyo Win, Christopher Pin. The loss of ATRX induces a sex-specific progression of pancreatic ductal adenocarcinoma in the presence of oncogenic KRASG12D [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Pancreatic Cancer; 2022 Sep 13-16; Boston, MA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2022;82(22 Suppl):Abstract nr C075.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,223

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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