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Enregistrement W4309245369 · doi:10.1002/cbic.202200564

Salt‐Toggled Capture Selection of Uric Acid Binding Aptamers

2022· article· en· W4309245369 sur OpenAlexaff
Yibo Liu, Juewen Liu

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAptamerHypoxanthineUric acidIsothermal titration calorimetryChemistryBiochemistryXanthineRasburicaseCombinatorial chemistrySystematic evolution of ligands by exponential enrichmentEnzymeMolecular biologyBiologyRNAHyperuricemiaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Uric acid is the end‐product of purine metabolism in humans and an important biomarker for many diseases. To achieve the detection of uric acid without using enzymes, we previously selected a DNA aptamer for uric acid with a K d of 1 μM but the aptamer required multiple Na + ions for binding. Saturated binding was achieved with around 700 mM Na + and the binding at the physiological condition was much weaker. In this work, a new selection was performed by alternating Mg 2+ ‐containing buffers with Na + and Li + . After 13 rounds of selection, a new aptamer sequence named UA‐Mg‐1 was obtained. Isothermal titration calorimetry confirmed aptamer binding in both selection buffers, and the K d was around 8 μM. The binding of UA‐Mg‐1 to UA required only Mg 2+ . This is an indicator of successful switching of metal dependency via the salt‐toggled selection method. The UA‐Mg‐1 aptamer was engineered into a fluorescent biosensor based on the strand‐displacement assay with a limit of detection of 0.5 μM uric acid in the selection buffer. Finally, comparison with the previously reported Na + ‐dependent aptamer and a xanthine/uric acid riboswitch was also made.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,623

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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