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Enregistrement W4309739673 · doi:10.3390/tropicalmed7110384

Investigating the Leishmania donovani sacp Gene and Its Role in Macrophage Infection and Survival in Mice

2022· article· en· W4309739673 sur OpenAlexafffund
Kayla Paulini, Patrick Lypaczewski, Wen‐Wei Zhang, Dilhan J. Perera, Momar Ndao, Greg Matlashewski

Notice bibliographique

RevueTropical Medicine and Infectious Disease · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchR. Howard Webster Foundation
Mots-clésLeishmania donovaniBiologyAmastigoteGeneVirulenceSpleenLeishmaniaGeneticsLeishmaniasisParasite hostingVisceral leishmaniasisImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The protozoan parasite Leishmania donovani is a causative agent of the neglected tropical disease known as visceral leishmaniasis, which can be lethal when untreated. Studying Leishmania viru-lence factors is crucial in determining how the parasite causes disease and identifying new targets for treatment. One potential virulence factor is L. donovani’s abundantly secreted protein: secreted acid phosphatase (SAcP). Whole-genome analysis revealed that the sacp gene was present in three copies in wild type L. donovani. Using CRISPR-Cas9 gene editing; we generated a sacp gene knockout termed LdΔSAcP, which demonstrated a loss of both the SAcP protein and an associated reduction in secreted acid phosphatase activity. Genome sequencing confirmed the precise dele-tion of the sacp gene in LdΔSAcP and identified several changes in the genome. LdΔSAcP demonstrated no significant changes in promastigote proliferation or its ability to infect and survive in macrophages compared to the wildtype strain. LdΔSAcP also demonstrated no change in murine liver infection; however, survival was impaired in the spleen. Taken together these results show that SAcP is not necessary for the survival of promastigotes in culture but may support long-term survival in the spleen. These observations also show that the use of CRISPR gene editing and WGS together are effective to investigate the function and phenotype of complex potential drug targets such as multicopy genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,517

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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