Terminal Uridylyltransferases TUT4/7 Regulate microRNA and mRNA Homeostasis
Notice bibliographique
Résumé
The terminal nucleotidyltransferases TUT4 and TUT7 (TUT4/7) regulate miRNA and mRNA stability by 3' end uridylation. In humans, TUT4/7 polyuridylates both mRNA and pre-miRNA, leading to degradation by the U-specific exonuclease DIS3L2. We investigate the role of uridylation-dependent decay in maintaining the transcriptome by transcriptionally profiling TUT4/7 deleted cells. We found that while the disruption of TUT4/7 expression increases the abundance of a variety of miRNAs, the let-7 family of miRNAs is the most impacted. Eight let-7 family miRNAs were increased in abundance in TUT4/7 deleted cells, and many let-7 mRNA targets are decreased in abundance. The mRNAs with increased abundance in the deletion strain are potential direct targets of TUT4/7, with transcripts coding for proteins involved in cellular stress response, rRNA processing, ribonucleoprotein complex biogenesis, cell-cell signaling, and regulation of metabolic processes most affected in the TUT4/7 knockout cells. We found that TUT4/7 indirectly control oncogenic signaling via the miRNA let-7a, which regulates AKT phosphorylation status. Finally, we find that, similar to fission yeast, the disruption of uridylation-dependent decay leads to major rearrangements of the transcriptome and reduces cell proliferation and adhesion.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».