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Enregistrement W4310009191 · doi:10.1101/2022.11.26.517555

The endocytic recycling pathway is controlled by the ADP-ribosylated GTPase Rab14

2022· preprint· en· W4310009191 sur OpenAlexfundno aff
Annunziata Corteggio, Matteo Lo Monte, Laura Schembri, Nina Dathan, Simone Di Paola, Giovanna Grimaldi, Daniela Corda

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesIndependent Electricity System OperatorAssociazione Italiana per la Ricerca sul Cancro
Mots-clésEndosomeRabCell biologyEndocytic cycleGTPaseEffectorSorting nexinTransferrin receptorBiologyChemistryBiochemistryIntracellularReceptorEndocytosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The GTPase Rab14 is localized at the trans-Golgi network and at the intermediate compartment associated to sorting/recycling endosomes-like structures of the transferrin-recycling pathway: as other Rab family members, it is involved in the regulation of intracellular vesicle trafficking, though its role and functional relationship with effector/endosomal proteins is still incomplete. We have analysed whether post-translational modifications could affect Rab14 activity: the results obtained define mono-ADP-ribosylation (MARylation) as the yet-unknown Rab14 modification, catalysed by the ADP-ribosyltransferase PARP12, which specifically modifies glutamic acid residues in position 159/162. This modification is essential for the Rab14-dependent endosome progression. Accordingly, recycling of the transferrin receptor is inhibited when MARylation of Rab14 is prevented by PARP12 knocking-down or inhibition, or by overexpression of Rab14 ADP-ribosylation-defective mutant. Under these conditions, Rab14 and transferrin receptors are withheld at the cell periphery at the level of the Rab4-RUFY1-positive sorting endosomes, indicating that the interaction of Rab14 with the dual effectors RUFY and then FIP1c (which specifically binds both Rab11 and Rab14) determines the progression between the Rab4-RUFY- and Rab11-FIP1c-specific vesicles. Therefore Rab14-MARylation determines the sequential binding of this GTPase to RUFY and FIP1c, thus controlling endosome progression ( i . e ., transferrin receptors recycling) through the Rab4-, Rab14- and Rab11-specific vesicles. This identifies a Rab14-specific compartment of the recycling pathway and a crucial enzymatic reaction amenable to pharmacological control.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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