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Enregistrement W4310082281 · doi:10.1002/psp4.12886

Delineating gene–environment effects using virtual twins of patients treated with clozapine

2022· article· en· W4310082281 sur OpenAlexaff
Sam Mostafa, Thomas M. Polasek, Chad Bousman, Amin Rostami‐Hodjegan, Leslie J. Sheffield, Ian Everall, Christos Pantelis, Carl M. J. Kirkpatrick

Notice bibliographique

RevueCPT Pharmacometrics & Systems Pharmacology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of AlbertaAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCovariateClozapineStatisticsVirtualizationGene–environment interactionSchizophrenia (object-oriented programming)Computer scienceEconometricsPsychologyGenotypeMathematicsBiologyPsychiatryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Studies that focus on individual covariates, while ignoring their interactions, may not be adequate for model‐informed precision dosing (MIPD) in any given patient. Genetic variations that influence protein synthesis should be studied in conjunction with environmental covariates, such as cigarette smoking. The aim of this study was to build virtual twins (VTs) of real patients receiving clozapine with interacting covariates related to genetics and environment and to delineate the impact of interacting covariates on predicted clozapine plasma concentrations. Clozapine‐treated patients with schizophrenia ( N = 42) with observed clozapine plasma concentrations, demographic, environmental, and genotype data were used to construct VTs in Simcyp. The effect of increased covariate virtualization was assessed by performing simulations under three conditions: “low” (demographic), “medium” (demographic and environmental interaction), and “high” (demographic and environmental/genotype interaction) covariate virtualization. Increasing covariate virtualization with interaction improved the coefficient of variation ( R 2 ) from 0.07 in the low model to 0.391 and 0.368 in the medium and high models, respectively. Whereas R 2 was similar between the medium and high models, the high covariate virtualization model had improved accuracy, with systematic bias of predicted clozapine plasma concentration improving from −138.48 ng/ml to −74.65 ng/ml. A high level of covariate virtualization (demographic, environmental, and genotype) may be required for MIPD using VTs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,188
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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