Signatures of EMT, immunosuppression, and inflammation in primary and recurrent human cutaneous squamous cell carcinoma at single-cell resolution
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The recurrence of cutaneous squamous cell carcinoma (cSCC) after surgery remains a key factor affecting cSCC outcomes, which is related to the reprogramming of the tumour microenvironment (TME). Herein, we utilized single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to examine the dynamic changes in epithelial cells, T cells, myeloid cells and fibroblasts between primary and recurrent cSCC. We uncovered the immunosuppressed microenvironment in recurrent cSCC, which exhibited a T-cell- excluded and SPP1 + TAM-enriched status. In recurrent cSCC, CD8 + T cells showed high exhaustion and low inflammatory features, while SPP1 + TAMs displayed global protumour characteristics, including decreased phagocytosis and inflammation as well as increased angiogenesis. Furthermore, we found that the subgroups of SPP1 + tumour- associated macrophages (TAMs) harboured distinct functions. SPP1 + CD209 high TAMs showed obvious features of phagocytosis, while SPP1 + CD209 low TAMs tended to have a high angiogenic ability. A subpopulation of tumour-specific keratinocytes (TSKs) showed significant epithelial–mesenchymal transition (EMT) features in recurrent cSCC, which might be due to their active communication with IL7R + cancer-associated fibroblasts (CAFs). In addition, we found that MDK could provoke different cell–cell interactions in cSCCs with distinctive staging. In primary cSCC, MDK was highly expressed in fibroblasts and could promote their proliferation and block the migration of tumour cells, while in recurrent cSCC, the high expression of MDK in TSKs promotes their proliferation and metastasis. Overall, our study provides insights into the critical mechanisms of cSCC progression, which might facilitate the development of a powerful system for the prevention and treatment of cSCC recurrence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».